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[发明专利]游离核酸的核酸酶相关末端特征分析-CN202180062583.9在审
发明人：卢煜明;赵慧君;陈君赐;江培勇;陈颖欣;林伟棋;韩小澄;彭文磊;丁晨 -专利权人：香港中文大学;格里尔有限责任公司
申请日： 2021-07-13 - 公布日： 2023-05-23 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：各种实施方案涉及使用在组织中影响无细胞DNA末端特征/基序和在DNA链之间突出端的大小的核酸酶表达。实施方案能够鉴定相对于正常细胞在异常细胞中被差异调节的核酸酶。实施方案能够确定核酸酶优先将DNA切割成具有以下特征的DNA分子：(i)特定的序列末端特征；或(ii)在第一链和第二链之间指定长度的突出端。能够基于DNA分子的量来确定生物样品的参数，所述DNA分子包括与特定序列末端特征对应的末端序列和/或与指定长度的突出端相关的所测量性质。所述参数能够用于确定组织类型的特征、临床相关DNA分子的浓度分数或生物样品中组织类型的异常水平。
游离核酸核酸酶相关末端特征分析

[发明专利]病毒相关联的癌症风险分层-CN202080027120.4在审
发明人：卢煜明;赵慧君;陈君赐;江培勇;林伟棋;吉璐 -专利权人：格里尔公司
申请日： 2020-04-01 - 公布日： 2021-11-26 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本文提供了基于对来自一对象的一生物样本的多个无细胞核酸分子的分析来对所述对象发展出一病原体相关联的疾病的风险进行分层的多种方法和多种系统。在各种示例中，筛选频率是基于风险分析来确定。本文还提供了用于分析多个无细胞核酸分子中一病原体基因组的多个变异模式的多种方法和多种系统。
病毒相关癌症风险分层

[发明专利]核酸重排和整合分析-CN201980056897.0在审
发明人：卢煜明;赵慧君;陈君赐;江培勇;林伟棋;张海强 -专利权人：格瑞尔公司
申请日： 2019-06-28 - 公布日： 2021-04-09 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本文中提供了用于识别嵌合核酸片段(例如生物体‑病原体嵌合核酸片段和染色体重排嵌合核酸片段)的方法和系统。本文中还提供了涉及确定生物样品中的病原体整合谱或染色体重排以及至少部分地基于生物样品中的病原体整合谱或染色体重排而确定病理学的分类的方法和系统。在本公开的某些方面中，对来自生物样品的无细胞核酸分子进行分析。
核酸重排整合分析

[发明专利]利用不含细胞的病毒核酸改善癌症筛选-CN201880055081.1在审
发明人：卢煜明;赵慧君;陈君赐;江培勇;林伟棋 -专利权人：香港中文大学
申请日： 2018-07-25 - 公布日： 2020-04-21 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：可分析生物样本混合物中不含细胞的DNA分子以检测病毒DNA。可测定病毒基因组中一个或多个位点处病毒DNA分子的甲基化。可依据在特定病毒基因组的一组位点处甲基化的多个不含细胞的DNA分子的一个或多个量来测量混合物甲基化程度。可依各种方式测定混合物甲基化程度，例如：依在一个位点处或跨越多个位点或区域甲基化的不含细胞的DNA分子的密度形式测定。可比较混合物甲基化程度与参考甲基化程度，例如由至少两个其它个体群组测定。群组可具有与特定病毒基因组相关联的不同类别(包括第一病状)。第一分类可依据比较来测定个体是否是具有第一病状。
利用细胞病毒核酸改善癌症筛选

[发明专利]使用核酸片段的诊断应用-CN201880008132.5在审
发明人：卢煜明;赵慧君;陈君赐;江培勇;林伟棋 -专利权人：香港中文大学;格里尔公司
申请日： 2018-01-25 - 公布日： 2019-09-27 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：各实施例涉及游离核酸的计数、片段化模式和尺寸的分析的应用(例如生物样品的分类)，所述游离核酸是例如血浆DNA和血清DNA，包括来自病原体，如病毒的核酸。一种应用的实施例可以确定个体是否患有具体病状。举例来说，本公开的方法可以确定个体是否患有癌症或肿瘤，或其它病变。另一种应用的实施例可以用于评估病状的阶段，或病状随时间的进展。举例来说，本公开的方法可以用于确定个体中癌症的阶段，或个体中癌症随时间的进展(例如使用在不同时间从个体获得的样品)。
游离核酸癌症应用片段化模式核酸片段生物样品诊断应用病原体血浆DNA 血清DNA 核酸病变肿瘤病毒分类评估分析

[发明专利]用于肿瘤检测的方法和系统-CN201780080329.5在审
发明人：欧金尼·纳姆萨拉伊夫;卢煜明;赵慧君;陈君赐;江培勇;孙坤;林伟棋 -专利权人：香港中文大学;格瑞尔公司
申请日： 2017-10-24 - 公布日： 2019-08-06 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本文提供了使用无细胞核酸样品改善癌症检测的阳性预测值的方法。各个实施方案针对于包括来自病原体(包括病毒)的核酸在内的无细胞DNA(例如血浆DNA和血清DNA)的片段化模式和大小的分析的应用(例如，诊断应用)。一个应用的实施方案可以确定受试者是否具有特定病况。例如，本公开内容的方法可以确定受试者是否具有癌症或肿瘤或其他病理学。另一应用的实施方案可用于评估病况的阶段，或病况随时间的进展。例如，本公开内容的方法可用于确定受试者的癌症阶段，或受试者的癌症随时间的进展(例如，使用在不同时间从受试者获得的样品)。
可用癌症应用片段化模式无细胞核酸癌症检测癌症阶段诊断应用肿瘤检测血浆DNA 血清DNA 病理学病原体无细胞核酸肿瘤病毒评估预测分析