本发明公开了一种通过辅助分泌高效表达重组猪α1干扰素的毕赤酵母,所述毕赤酵母包括如SEQ ID No.1所示DNA序列的重组猪α1干扰素基因片段和如SEQ ID No.2所示DNA序列的蛋白质二硫键异构酶PDI基因片段;通过在毕赤酵母中整合多拷贝重组猪α1干扰素基因片段和插入表达酵母蛋白质二硫键异构酶的DNA片段,辅助蛋白质在酵母细胞内折叠,减少干扰素在细胞内堆积,提高猪α1干扰素分泌到细胞外的量,猪干扰素α1的表达量达到了1.43g/L,较只整合干扰素表达盒的菌株提高了40%以上,显著提高了菌体发酵生产猪α1干扰素的水平,使高拷贝菌株的生产性能得到有效发挥。