本发明专利涉及InDel标记的检测引物及其在无毛刺大白菜育种中的应用。大白菜InDel标记TR‑1的检测引物，该检测引物为一对，上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明首次公开了与大白菜毛刺相关的InDel标记TR‑1及其检测引物，通过对有毛和无毛大白菜自交系以及二者杂交后产生的F2代分离群体材料的DNA进行PCR扩增，并利用8％变性聚丙烯酰氨凝胶电泳进行检测，发现与大白菜毛刺相关的InDel标记TR‑1可明显区分有毛和无毛大白菜品种，可用于无毛大白菜新品种的选育。
本发明公开了一种鉴定大白菜TNL‑WRKY的编码基因Bra013400野生型和突变体的共显性标记，所述共显性标记包括：与野生型相关的标记Bra013400W，片段大小140bp，如SEQ ID No.1所示；与突变体相关的标记Bra013400m，大小135bp，如SEQ ID No.2所示。本发明获得了一个位于A01染色体上可能编码TNL‑WRKY的基因Bra013400的野生型和突变体，并开发了鉴定野生型和突变体的共显性标记。可以将该标记用于筛查大白菜自然群体，提供高效的大白菜抗病R基因位点的检测手段，通过本发明的共显性标记检测出的携带野生型基因的材料可以作为抗病育种的重要材料，用于培育抗病大白菜新品种。
本发明提供了黄瓜雌性SNP分子标记及其应用，即位于黄瓜Csa6M496990.1基因组第六号染色体如SEQ ID NO.3所示核苷酸序列第116位多态性为T/C的SNP1和第222位多态性为G/A的SNP2，通过一对引物对的扩增就可得到这两个变异位点的序列信息，用于黄瓜雌性系的辅助选择以及黄瓜分子标记辅助育种。该方法可替代传统的以表型观察判断的方法，使结果更加准确可靠。其在黄瓜苗期即可在室内进行，比在田间开花坐果期人工观察便捷，可用于大规模筛选育种材料，节约土地和成本，大大加速黄瓜育种进程。
