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[发明专利]一种基于高通量引物设计的DNA存储系统文件选择性访问方法-CN202310918094.X在审
发明人：宋萍;翁智;司云培 -专利权人：上海交通大学
申请日： 2023-07-25 - 公布日： 2023-10-27 - 主分类号： G16B25/20 文献下载
摘要：本发明提供一种基于高通量引物设计的DNA存储系统文件选择性访问方法，包括以下步骤：1)基于二进制与DNA碱基的映射关系，将数字信息转化为DNA序列；2)设计高通量引物组并添加至不同文件的DNA序列两端；3)合成DNA并放置在合适的条件下保存；4)基于设计的引物组，通过多重PCR选择性扩增待访问内容的序列；5)通过测序读取DNA序列信息；6)基于DNA碱基与二进制信息的映射关系对测序数据进行解码，恢复文件。本发明通过对引物GC含量、均聚物、自身互补性、ΔG、二级结构进行评估，并且对所有引物自身及引物间二聚体形成概率进行打分，进行高通量引物组设计，实现了在DNA数据存储系统中更多文件的随机访问。
一种基于通量引物设计 dna 存储系统文件选择性访问方法

[发明专利]一种DNA数据存储的选择性访问方法-CN202310366711.X在审
发明人：樊春海;宋萍;翁智;司云培 -专利权人：祥符实验室
申请日： 2023-04-07 - 公布日： 2023-07-11 - 主分类号： G16B50/00 文献下载
摘要：本发明提供一种DNA数据存储的选择性访问方法，包括以下步骤：S1：基于二进制与DNA碱基的映射关系，将数字信息转化为DNA序列；S2：基于GC含量、均聚物、引物结合自由能变化ΔG、自身互补性、以及二级结构的综合考量设计引物组；S3：合成DNA序列；S4：选择待访问文件的相对应引物组，通过多重PCR选择性扩增待访问内容的DNA序列；S5：通过测序读取DNA序列信息；S6：对读取的DNA序列信息进行解码，恢复文件。本发明基于对GC含量、均聚物、引物结合自由能变化ΔG、自身互补性、以及二级结构的一系列综合考量设计PCR引物的方法，最终实现对DNA数据库中目标文件的低成本的、高准确度的、快速的读取。
一种 dna 数据存储选择性访问方法