本发明涉及生物技术领域的纳豆芽孢杆菌谷氨酸脱氢酶(GDH)编码基因、蛋白及菌株。纳豆芽孢杆菌谷氨酸脱氢酶编码基因具有如SEQ ID NO:1所示的碱基序列;该基因编码的蛋白质具有如SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列;本发明还提供了一种纳豆芽孢杆菌(Bacillus Natto)SJTU1-4CGMCC NO.2801。本发明确定了纳豆芽孢杆菌的谷氨酸脱氢酶编码序列,即RocG基因,为将来研究酶的活性位点和通过定点突变改变发酵菌株GDH酶活从而生产出低氨纳豆奠定了基础,RocG基因缺失菌株的氨产量可降低50%。