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[发明专利]基于内参序列的细菌菌群组成与绝对含量检测的方法-CN201910295389.X有效
发明人：姜正文;方欧;徐流凤;王滔 -专利权人： 上海天昊生物科技有限公司
申请日： 2019-04-12 - 公布日： 2023-06-30 - 主分类号： C12Q1/689 文献下载
摘要：本发明提供了基于内参序列的细菌菌群组成与绝对含量检测的方法。具体地，本发明提供了一种用于细菌菌群组成与绝对含量检测的定量标准品，其包括至少3条选自R1‑R9的定量参考序列，优选地还包括指示内参。本发明提供的方法可以准确地检测细菌菌群组成和含量，有结果准确、检验快速、成本低廉等优点。
基于内参序列细菌组成绝对含量检测方法

[发明专利]基于限制性酶切的CpG岛甲基化富集测序技术-CN202211525634.X在审
发明人：姜正文;方欧;王果;林芳斌 -专利权人：天昊基因科技（苏州）有限公司;上海天昊生物科技有限公司
申请日： 2022-11-30 - 公布日： 2023-04-18 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明提供一种简便且高效的甲基化测序文库构建方法，在传统的全基因组甲基化测序方法的基础上增加限制性内切酶组合酶切，实现对CpG岛尤其是甲基化修饰的CpG岛富集测序。本发明的方法降低测序成本并省去了复杂的操作，适用于针对CpG岛的甲基化的研究与应用。
基于限制性 cpg 甲基化富集技术

[发明专利]羟甲基化分析中DNA整体转化效率的评估方法-CN202110897064.6在审
发明人：姜正文;王果;方欧 -专利权人： 上海天昊生物科技有限公司
申请日： 2021-08-05 - 公布日： 2021-11-16 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明提供一种羟甲基化分析中DNA整体转化效率的评估方法。在羟甲基化检测分析中，DNA转化效率的检测至关重要，但由于当前转化效率检测技术的应用限制及转化效率不佳带来的一系列问题，急需一种快速、准确且低成本的适用于测序前对DNA转化效率进行检测的方法。本发明提供了一种用于评估羟甲基化分析中DNA整体转化效率的外源参照核酸片段组合物，通过一个修饰位点的转化效率即可反应片段的整体转化效率，再结合SNaPshot方法，通过延伸位点碱基峰的峰高比估算DNA整体转化效率。本申请的评估方法快速准确、具有普适性且成本低廉，将该方法用于二代测序之前，对转化效率进行质控，提高DNA羟甲基化分析准确性和高效性。
甲基化分析 dna 整体转化效率评估方法

[发明专利]一种基于多重PCR的基因组DNA完整性检测的方法-CN201911415433.2在审
发明人：姜正文;方欧 -专利权人： 上海天昊生物科技有限公司
申请日： 2019-12-31 - 公布日： 2021-07-16 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明提供了一种基于多重PCR的基因组DNA完整性检测的方法。具体地，本发明使用多对扩增产物长度呈梯度的引物对，对待测DNA和标准基因组DNA进行多重PCR扩增，分别检测对应于待测DNA的第一扩增产物的峰高F1和对应于标准基因组DNA的第二扩增产物的峰高F2，基于所述峰高F1和F2，从而获得核酸样本的相对扩增度Krel，并基于所述核酸样本的相对扩增度Krel，从而评估核酸样本的基因组完整性。本发明的方法对基因组完整性的评估具有非常高的准确性。
一种基于多重 pcr 基因组 dna 完整性检测方法

[发明专利]一种DNA接头及其制备方法和应用-CN202010221354.4在审
发明人：姜正文;方欧 -专利权人： 上海天昊生物科技有限公司
申请日： 2020-03-26 - 公布日： 2020-07-10 - 主分类号： C12Q1/6855 文献下载
摘要：本发明涉及一种DNA接头，所述的DNA接头的非连接末端的5’和/或3’封闭。本发明的DNA接头可以避免非连接末端与DNA片段的非特异性连接，提升接头与DNA片段的连接效率，从而提升文库转化效率，本发明的DNA接头的制备方法简单，文库的构建方法简单、高效、成本低廉，可以避免高额的改造酶或商品试剂盒的花销。
一种 dna 接头及其制备方法应用

[发明专利]一种基于多重循环延伸连接的靶基因区域富集新方法-CN201410852512.0在审
发明人：姜正文;杨锋 -专利权人：天昊生物医药科技（苏州）有限公司;上海天昊生物科技有限公司
申请日： 2014-12-31 - 公布日： 2016-07-27 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供了一种基于多重循环延伸连接的靶基因区域富集新方法，实验结果表明，该方法可以实现多重目的基因的基因片段富集，目的基因片段数可以是数十至数万。多重目的基因片段的富集产物可以通过修饰及纯化定量后用于各种二代测序平台的测序分析。
一种基于多重循环延伸连接基因区域富集新方法

[发明专利]多重核酸分析-CN201280001947.3在审
发明人：姜正文;余锋;李才华 -专利权人：天昊生物医药科技（苏州）有限公司;上海天昊生物科技有限公司
申请日： 2012-09-10 - 公布日： 2014-07-30 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供一种多重核酸分析方法。所述方法包括步骤：将探针组与样本中的目标核酸杂交；连接杂交的探针；扩增连接的探针；和检测扩增产物以确定样本中目标核酸是否存在或量。多重性的实现可部分通过在引物中添加可检测基团和插入填充序列以致于可以基于可检测基团和片段大小鉴定扩增产物。本发明还提供检测拷贝数小变化的灵敏方法，该方法通过检测测试样本中核酸上多个目标位点的拷贝数与对照样本比较，接着基于数个目标位点的检测拷贝数确定核酸的拷贝数。此外，本发明提供用于多重核酸分析和用于拷贝数小变化测定的试剂盒。
多重核酸分析

[发明专利]一种高通量核酸分析方法及其应用-CN201210581830.9有效
发明人：姜正文;杨锋 -专利权人： 上海天昊生物科技有限公司;天昊生物医药科技（苏州）有限公司
申请日： 2012-12-27 - 公布日： 2014-07-02 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及一种高通量基因分析方法及其应用，具体地，包括步骤：对于待分析的n种目的核酸片段，针对每个目的核酸片段，提供结合于所述目的核酸片段的不同结合区的至少2个特异探针，所述的各特异探针具有特异结合区和通用序列区，并且所述的特异结合区的序列与目的核酸片段的结合区的序列互补，而所述通用序列区的序列对应于高通量单分子或单分子扩增簇测序平台的测序引物序列，其中n为≥40的正整数；将含待分析的目的核酸片段的核酸样本与所述探针杂交，并连接所述探针，从而获得探针连接产物的混合物；用所述测序引物对探针连接产物混合物或其扩增产物进行测序，并进行分析，从而实现高通量目的基因片段的定量分析的目的。
一种通量核酸分析方法及其应用

[发明专利]Y-STR的应用-CN201110428865.4无效
发明人：姜正文;彭冬铂;李才华 -专利权人： 上海天昊生物科技有限公司
申请日： 2011-12-19 - 公布日： 2012-08-01 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开一种Y-STR的应用，用于个体鉴定，所述Y-STR选自DYG1～DYG36中的任意一个或任意两个以上组合。本发明还公开了一种用于个体鉴定的检测试剂盒和检测方法。本发明将筛选出的高突变率的36个新Y-STR位点有效应用于个体鉴定，分辨率和精确度显著提高。
str 应用

[发明专利]基因多态检测方法及试剂盒-CN201110426196.7有效
发明人：姜正文;彭冬铂;孙斯平 -专利权人： 上海天昊生物科技有限公司
申请日： 2011-12-16 - 公布日： 2012-04-04 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开一种基因多态检测方法，包括以下步骤：针对目标基因设计多重PCR引物，每个目标基因包含限制性内切酶序列；设计内对照DNA片段，该内对照DNA片段包含目标基因的限制性内切酶序列；对待测样本进行多重PCR扩增；将PCR扩增产物和内对照DNA片段混匀，用限制性内切酶进行酶切；酶切产物经变性后，通过毛细管电泳将不同长度的片段分开，收集每个条带的位置信息及信号强度；计算样本每个目标基因片段酶切前后的峰高或面积比、以及内对照DNA片段酶切前后的峰高或面积比，得待测样本目标基因片段的遗传多态性。本发明还公开了一种基因多态检测试剂盒。本发明基因多态检测方法，能在一个反应体系中快速、精确地同时检测多个样本的多个目标基因的遗传多态性。
基因检测方法试剂盒

[发明专利]多重基因拷贝数检测试剂盒和方法-CN201010180551.2有效
发明人：姜正文;马瑞晓 -专利权人： 上海天昊生物科技有限公司
申请日： 2010-05-24 - 公布日： 2011-06-08 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开一种多重基因拷贝数检测试剂盒，主要包括有：针对待测的目标基因设计的多重PCR引物；定量的针对不同待测的目标基因的内对照DNA片段；至少一对参照基因的多重PCR引物；定量的参照基因的内对照DNA片段；上述同种荧光标记的多重PCR引物对应扩增产物的长度有差异，以至于扩增产物在毛细管电泳分析中任意两个产物条带不重叠。本发明还公开了一种多重基因拷贝数检测方法。本发明多重基因拷贝数检测试剂盒和检测方法，不仅能多个基因位点同时快速检测，而且具有很高的精确性。
多重基因拷贝检测试剂盒方法

[发明专利]人类原癌基因KRAS的检测方法及试剂盒-CN200810203261.8无效
发明人：姜正文;丁达 -专利权人： 上海天昊生物科技有限公司
申请日： 2008-11-24 - 公布日： 2010-06-16 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供了一种KRAS基因突变的检测方法和试剂盒，所述检测方法包括步骤：(a)抽提样品中的DNA，用特异性引物在特定的扩增条件下进行PCR扩增；(b)对扩增产物进行测序，与正常KRAS基因比较，是否存在基因突变。所述特异性引物为针对KRAS基因不同外显子的2-4对引物。采用本发明检测方法和试剂盒，可以提高检测速度，节省试剂和时间，利用本发明检测结果可以指导消化道肿瘤临床化疗的靶向药物的用药。
人类基因 kras 检测方法试剂盒

[发明专利]分支杆菌的鉴定方法-CN200810207432.4无效
发明人：丁达;王一;乐军 -专利权人： 上海天昊生物科技有限公司
申请日： 2008-12-19 - 公布日： 2009-09-16 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明揭露了一种分支杆菌的鉴定方法，包括如下步骤：获取多种分支杆菌的多个标准序列，以生成分支杆菌序列数据库。对所述多个标准序列进行比对，得到这些序列共有的保守区段。根据所述保守区段制备一对PCR引物。使用所述PCR引物对待测分支杆菌的DNA溶液进行PCR扩增，从而得到所述待测分支杆菌的扩增产物。对所述扩增产物进行测序反应，得到测序产物。对所述测序产物进行测序分析，得到待测分支杆菌的序列。通过比较所述待测序列和所述分支杆菌序列数据库中的标准序列，确定所述待测分支杆菌的类型。由于根据多种分支杆菌的标志序列的保守区段设计PCR引物，因此所有的PCR和测序只需一对引物，大大减少了实验种所需要的寡核苷酸的数量。
分支杆菌鉴定方法

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