本公开涉及一种具核梭杆菌FomA蛋白质疫苗及其制备方法和应用。首先将去除信号肽序列且与MBP标签相连的FomA基因连接至表达载体中,再转化大肠杆菌,诱导表达后,Amylose Resin High Flow亲和纯化FomA重组蛋白质,最后将MBP标签使用tev酶酶切去除,得到具核梭杆菌FomA蛋白质疫苗;所述疫苗具有稳定性好,能够有效的提升机体对于具核梭杆菌的免疫能力,提升生存率,延缓结肠肿瘤的发生和发展;在APCMin/+小鼠模型中,FomA蛋白质疫苗对小鼠具有显著的保护作用,可作为新的结肠肿瘤疫苗候选物,具有较大的应用前景。