本发明提供了一种检测后极性白内障的分子标记、引物对和试剂盒,属于白内障检测和治疗技术领域,所述分子标记位于PITX3基因编码区域由起始密码子起第640~656位,所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No:1所示;所述分子标记为缺失突变。当PITX3基因编码区域缺失所述分子标记时,表现为潜在后极性白内障,当PITX3基因编码区域存在所述分子标记时,表现为非潜在后极性白内障。所述分子标记能够作为检测后极性白内障的分子标记,是一种有效的进行后极性白内障基因诊断、产前基因筛查及遗传咨询的途径,可以有效的用于临床患者及胎儿绒毛或羊水进行PITX3基因突变位点的的快速检测。