本发明公开了一种芥菜抗病蛋白BjMYB9及其编码基因序列和应用,抗病蛋白BjMYB9其氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示,编码基因其核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。通过酵母单杂交技术筛选到能够和芥菜抗病基因BjCHI1的启动子BjC‑P中的真菌诱导核心元件W‑box‑like‑4特异结合的R2R3‑MYB型转录因子,命名为BjMYB9。BjMYB9基因在芥菜中RNA表达明显受到真菌的诱导表达,该基因在模式植物拟南芥过表达后能够明显增强拟南芥对葡萄灰霉菌的抗性,为揭示植物抗病机制及培育抗病品种提供了实验基础和基因资源。