本发明公开了一种长吻鮠雄性性别特异性分子标记及其扩增引物和遗传性别鉴定方法。所述长吻鮠雄性特异性分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,其扩增引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示。利用扩增引物对长吻鮠基因组DNA进行PCR扩增,产物进行电泳检测,若扩增出特异性条带,则长吻鮠鉴定为雄性个体,若未扩增出特异性目的条带,则为雌性个体,该遗传性别鉴定方法简单、快速、直接,且准确率高,对鱼体伤害小,不受长吻鮠发育时期的限制,解决了长吻鮠发育早期性别鉴定困难的难题,为生产上实现长吻鮠的性别控制育种具有重要意义。