本发明公开了一种预测冠心病易感性的方法,通过提取宿主细胞基因组DNA,测定受试者的KDR基因多态性-604、1192、1719位点(分别是rs2071559、rs2305948、和rs1870377)的基因型,预测受试者对冠心病的易感性:KDR基因型为T/T纯合子时,受试者的易感性最低;三个位点的危险等位基因-604C,1192A,1719A,分别增加冠心病的风险为1.24,1.32,1.38倍。同时具有3个危险等位基因的受试者的冠心病易感性最高。本发明中KDR基因的单核苷酸多态性(SNP)具有SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的核酸序列的3个位点,是与冠心病发病相关的高风险位点之一。本发明的优点是:首次阐明了KDR基因多态性位点与冠心病的相关性,提供了一种预测冠心病易感性的方法,该方法可用于冠心病的预防、辅助诊断和治疗,还可以用于新药研发。