本发明属于猪遗传标记筛选领域,具体涉及MMP2基因多态性作为猪产仔数性状的遗传标记及应用。从MMP2基因内含子13上克隆得到遗传标记,序列如SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2所示。其中:TT基因型的头胎产活仔数显著高于TA基因型;AA基因型的经产死胎数显著高于TA基因型;AA基因型的总胎次死胎数极显著高于TA基因型;AA基因型的总胎次产活仔数显著高于TA基因型,TA基因型是减少死胎数有益基因型可用于大白猪活产仔数和死胎数性状的检测。
本发明公开了一种检测猪窝产活仔数性状的方法。片段的自5′末端起第71位核苷酸是G还是A;检测待测猪的基因组中SEQ ID NO:2所示DNA片段的自5′末端起第81位核苷酸是C还是A;确定所述待测猪的单倍体型,根据所述单倍体型确定所述待测猪的窝产活仔数性状本发明方法可在发育早期检测猪的繁殖性状,了解猪的遗传分化程度,对于猪的不同基因型的分型、筛选及辅助育种提供了有用的分子标记,其选择、改变对于提高母猪窝产活仔数具有重要意义。