[发明专利]一种基于宏转录组学和宏基因组学的环境中抗生素抗性基因的活性定量及宿主鉴定方法在审
申请号: | 202110740585.0 | 申请日: | 2021-06-30 |
公开(公告)号: | CN113337591A | 公开(公告)日: | 2021-09-03 |
发明(设计)人: | 李炳;张家禹;梁贺彬;黄锦;雷华新 | 申请(专利权)人: | 清华大学深圳国际研究生院 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;G16B20/00;G16B30/00;G16B35/00 |
代理公司: | 北京市诚辉律师事务所 11430 | 代理人: | 范盈;李玉娜 |
地址: | 518055 广东省深圳市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明涉及一种基于宏转录组学和宏基因组学的环境中新型抗生素抗性基因的活性定量方法。具体包括以下步骤:1)从环境微生物样本中提取总DNA和RNA;2)DNA样品进行宏基因组测序;RNA样品进行宏转录组测序;3)通过对宏基因组测序以及宏转录组测序结果进行分析,识别新型抗生素抗性基因及其宿主,并对其活性进行定量。本发明的方法不依赖菌株分离培养,结合了宏基因组和宏转录组方法能够实现环境微生物样品中抗生素抗性基因的活性定量及其宿主鉴定。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 转录 宏基 环境 抗生素 抗性 基因 活性 定量 宿主 鉴定 方法 | ||
【主权项】:
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