[发明专利]一种基于深度学习的配体化合物快速预筛选方法有效

专利信息
申请号: 202110697840.8 申请日: 2021-06-23
公开(公告)号: CN113393911B 公开(公告)日: 2022-08-19
发明(设计)人: 张树科;靳彦召;王琪;贾庆忠;赵书良;赵金金;陈明 申请(专利权)人: 石家庄鲜虞数字生物科技有限公司;河北师范大学;河北医科大学;河北省药品医疗器械检验研究院(河北省化妆品检验研究中心)
主分类号: G16C20/50 分类号: G16C20/50;G16C20/64;G16C20/70;G16C20/90;G06N3/04;G06N3/08
代理公司: 北京百年育人知识产权代理有限公司 11968 代理人: 龙钰
地址: 050024 河*** 国省代码: 河北;13
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摘要: 发明提供一种基于深度学习的配体化合物快速预筛选方法。包括如下步骤:S1、构建数据集,将配体化合物与受体蛋白质结合位点的氨基酸序列信息进行编码;S2、将配体与受体结构向量结合起来,输入到深度神经网络,输出亲和力评分,模型采用监督学习的方式进行训练;S3、按照亲和力评分结果进行排序,筛选出阳性化合物,剔除大量阴性化合物;S4、获取阳性化合物分子指纹,基于相似度或距离度量方法进行聚类;S5、取每个簇中评分最高的化合物,作为潜在活性化合物。本发明实现了配体化合物的快速预筛选,通过对阳性化合物的聚类分析,可以去除冗余,保证配体化合物的结构多样性,提高预测速度和准确性。
搜索关键词: 一种 基于 深度 学习 化合物 快速 筛选 方法
【主权项】:
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