[发明专利]大规模单细胞转录组数据高效聚类方法有效
| 申请号： | 202110459530.2 | 申请日： | 2021-04-27 |
| 公开（公告）号： | CN113178233B | 公开（公告）日： | 2023-04-28 |
| 发明（设计）人： | 高琳;史凯玥;胡宇轩;叶育森;张晨星 | 申请（专利权）人： | 西安电子科技大学 |
| 主分类号： | G16B40/30 | 分类号： | G16B40/30;G06F18/23213;G16B30/10 |
| 代理公司： | 陕西电子工业专利中心 61205 | 代理人： | 王品华;朱红星 |
| 地址： | 710071*** | 国省代码： | 陕西;61 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种大规模单细胞转录组数据高效聚类方法，主要解决现有大规模聚类方法运行时间长，效率低，甚至不能正常运行的问题。其方案为：对大规模单细胞转录组数据的基因特征进行筛选，筛选出高表达的基因，初步降低细胞维度；对细胞进行密度抽样，使抽样出的一组新样本尽可能的包含更完整的细胞类型；对抽样出的新样本进行共享最近邻SNN构图图并使用Louvain算法对共享最近邻SNN图进行聚类，获得新样本中细胞的细胞类型；对于剩下的未参与聚类的细胞，分别在已知标签的细胞中查找近似k近邻，k近邻中最多的那一类细胞的类型，即为未参与聚类的细胞类型。本发明运行时间短，效率高，可用于大规模细胞类型识别，细胞轨迹推理。 | ||
| 搜索关键词： | 大规模 单细胞 转录 数据 高效 方法 | ||
【主权项】：
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