[发明专利]基于片段重叠群的双面基因组片段填充方法及装置在审
| 申请号： | 202011597411.5 | 申请日： | 2020-12-29 |
| 公开（公告）号： | CN112634989A | 公开（公告）日： | 2021-04-09 |
| 发明（设计）人： | 柳楠;李春良;李胜华;朱永琦;李晓峰;郑晶玲;尤宝山;王向辉 | 申请（专利权）人： | 山东建筑大学 |
| 主分类号： | G16B25/10 | 分类号： | G16B25/10 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 250101 山东省济南*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于片段重叠群的基因组片段填充方法及装置，该方法包括以下步骤：计算得到缺失基因；对最大缺失基因串分类；合并符合条件的最大缺失基因串；搜索Type‑1类型串，执行Type‑1串插入算法；搜索无slot的Type‑3‑II类型串，执行no‑slot‑Type‑3‑II串插入算法；搜索Type‑2、Type‑3类型串，处理矛盾公共基因相关的公共邻接关系，执行Type‑23串插入算法。本发明基于片段重叠群进行计算，形式更一般，应用更广泛。该填充方法搜索速度快，填充效率高，能够降低基于片段重叠群的基因组片段填充的时间、空间复杂度，提高填充的敏感性和特异性。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 片段 重叠 双面 基因组 填充 方法 装置 | ||
【主权项】：
暂无信息
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