[发明专利]基于句法模式识别的药物小分子毒性预测的方法在审
| 申请号： | 202010460271.0 | 申请日： | 2020-05-27 |
| 公开（公告）号： | CN111640470A | 公开（公告）日： | 2020-09-08 |
| 发明（设计）人： | 牛张明;韦德·门佩斯-史密斯 | 申请（专利权）人： | 牛张明;韦德·门佩斯-史密斯 |
| 主分类号： | G16C20/30 | 分类号： | G16C20/30;G16C20/70;G16B15/30;G16B40/00;G06F40/211;G06F40/30;G06F40/253 |
| 代理公司： | 上海智晟知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 31313 | 代理人： | 张东梅 |
| 地址： | 浙江省杭州市钱塘*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于句法模式识别的药物小分子毒性预测的方法，包括：获取数据集；对所述数据集进行预处理，包括将所述数据集中的所有化合物分子用SMILES表示，对所有分子的SMILES表达式做标准化处理，统一分子SMILES表达式中的原子、键、连接关系的编码方式和顺序，然后进行去重复化处理；对预处理的数据集进行编码，其中通过独热编码对SMILES序列的单个元素、单个数字、单个符号以及整个方括号看作一个基元片段。每个基元片段本身是具有化学意义和指向性的，任何基元片段的组合也是符合化学规则，所述所有分子的SMILES表达式转换为向量组合；构建句法模式识别模型；将向量组合输入所述句法模式识别模型，预估分子是否含有特定靶标的毒性；以及对所述句法模式识别模型进行评估。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 句法 模式识别 药物 分子 毒性 预测 方法 | ||
【主权项】：
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