[发明专利]一种蛋白质冷冻电镜结构解析模型训练方法和解析方法有效

专利信息
申请号: 202010018788.4 申请日: 2020-01-08
公开(公告)号: CN111210869B 公开(公告)日: 2023-06-20
发明(设计)人: 杨跃东;陈晟;李雄俊;卢宇彤 申请(专利权)人: 中山大学
主分类号: G16B15/00 分类号: G16B15/00;G16B20/00;G06N3/0464;G06N3/08
代理公司: 广州润禾知识产权代理事务所(普通合伙) 44446 代理人: 欧秋望
地址: 510275 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明涉及一种蛋白质冷冻电镜结构解析模型训练方法和解析方法,训练方法包括:以蛋白质电子云密度图像中像素密度高于预设密度值的像素点为中心,按预设大小框选出子图像,并将子图像根据其中心是否为Cα位点分为正样本和负样本;根据正样本和负样本对卷积神经网络模型进行训练,训练出Cα位点预测模型;根据正样本对卷积神经网络模型进行训练,训练出二级结构预测模型和氨基酸类型预测模型。通过训练好的三种模型预测蛋白质冷冻电镜图像中的Cα位点、每个Cα位点的二级结构和氨基酸类型,并将这些Cα位点与已知的蛋白质序列位点一一配对,本发明可以高效、准确地解析蛋白质冷冻电镜图像并建立该蛋白质主链结构的模型。
搜索关键词: 一种 蛋白质 冷冻 结构 解析 模型 训练 方法
【主权项】:
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