[发明专利]基于图卷积的面向ErbB靶向蛋白家族的打分函数构建方法有效
| 申请号： | 201911064826.3 | 申请日： | 2019-11-04 |
| 公开（公告）号： | CN110767266B | 公开（公告）日： | 2023-04-18 |
| 发明（设计）人： | 杨帅;王卓亚;王小红;赵志刚;窦方坤;曹皓伟;魏志强;刘昊;杨金波 | 申请（专利权）人： | 山东省计算中心(国家超级计算济南中心);青岛海洋科学与技术国家实验室发展中心 |
| 主分类号： | G16B40/00 | 分类号： | G16B40/00;G16B15/30 |
| 代理公司： | 北京华际知识产权代理有限公司 11676 | 代理人： | 褚庆森 |
| 地址： | 250014 山东省济*** | 国省代码： | 山东;37 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明的基于图卷积的面向ErbB靶向蛋白家族的打分函数构建方法，包括：a).构建ErbB靶向蛋白数据，对于ErbB包含的4个受体酪氨酸激酶ErbB‑1、ErbB‑2、ErbB‑3和ErbB‑4均构建靶向蛋白数据集；b).扩大数据集规模，采用原始构象、旋转构象、优化构象的方法扩大数据集规模；c).构建ErbB靶向蛋白家族机器学习打分函数模型；d).模型的训练和评估。本发明的打分函数构建方法，建了一个ErbB蛋白家族机器学习分子亲和力评估数据集，为ErbB蛋白家族的机器学习任务奠定了数据基础；通过GCN技术突破了经典打分函数的瓶颈，提高了打分函数的性能，解决了机器学习打分函数通用模型准确率低的问题。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 图卷 面向 erbb 靶向 蛋白 家族 打分 函数 构建 方法 | ||
【主权项】：
1.一种基于图卷积的面向ErbB靶向蛋白家族的打分函数构建方法，其特征在于，通过以下步骤来实现：/na).构建ErbB靶向蛋白数据，对于ErbB包含的4个受体酪氨酸激酶ErbB-1、ErbB-2、ErbB-3和ErbB-4均构建靶向蛋白数据集，靶向蛋白数据集包括蛋白质-配体复合物信息列表、蛋白质-配体亲和力数据、配体结构数据、蛋白质结构数据、蛋白质-配体结合位点数据，其中蛋白质-配体亲和力数据包括解离常数K
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于山东省计算中心(国家超级计算济南中心);青岛海洋科学与技术国家实验室发展中心，未经山东省计算中心(国家超级计算济南中心);青岛海洋科学与技术国家实验室发展中心许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201911064826.3/，转载请声明来源钻瓜专利网。
