[发明专利]一种二项树模型的模体搜索方法、装置、设备与存储介质有效
申请号: | 201910181483.2 | 申请日: | 2019-03-11 |
公开(公告)号: | CN110070908B | 公开(公告)日: | 2021-08-13 |
发明(设计)人: | 于强;张晓 | 申请(专利权)人: | 西安电子科技大学 |
主分类号: | G16B10/00 | 分类号: | G16B10/00;G16B20/00 |
代理公司: | 西安嘉思特知识产权代理事务所(普通合伙) 61230 | 代理人: | 张捷 |
地址: | 710071*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | 本发明涉及一种二项树模型的模体搜索方法、装置、设备与存储介质,该方法包括:获取DNA序列大数据集、获取所述DNA序列大数据集的植入模体参数;根据所述DNA序列大数据集、所述植入模体参数,得到第一l‑mer集;根据所述第一l‑mer集,构建二项树模型;根据第一得分模型,从所述二项树模型中确定所述植入模体。本发明通过构建二项树模型的方法,不仅能够从DNA序列大数据集中搜索出了植入模体,同时在找出植入模体的运行时间数量级地快速于其它植入模体搜索方法。 | ||
搜索关键词: | 一种 二项树 模型 搜索 方法 装置 设备 存储 介质 | ||
【主权项】:
1.一种二项树模型的模体搜索方法,其特征在于,包括:获取DNA序列大数据集、获取所述DNA序列大数据集的植入模体参数;根据所述DNA序列大数据集、所述植入模体参数,得到第一l‑mer集;根据所述第一l‑mer集,构建二项树模型;根据第一得分模型,从所述二项树模型中确定所述植入模体。
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