[发明专利]抗体靶向的重组融合蛋白以及其在表观遗传学中的应用

摘要

本发明公开抗体靶向的重组融合蛋白以及其在表观遗传学中的应用，本发明所述融合蛋白包括ABP‑L‑DFE的结构，其中ABP位于融合蛋白的N端，表示具有结合抗体功能的结构域，L表示连接肽，DFE表示具有DNA片段化功能的结构域。本发明所述的重组融合蛋白可以改善ChIP‑seq技术，简化操作，提高数据质量，降低操作难度，扩展应用范围，尤其是在珍贵、少量细胞上的应用。

主权项

1.一种融合蛋白，选自以下任一：ABP‑L‑DFE1、ABP‑L‑DFE2、ABP‑L‑DFE3、ABP‑L‑DFE4、ABP‑L‑DFE5、ABP‑L‑DFE6、ABP‑L‑DFE7、ABP‑L‑DFE9、ABP‑L‑DFE10、ABP‑L‑DFE11、ABP‑L‑DFE12、ABP‑L‑DFE14；其中：命名为ABP‑L‑DFE‑1的融合蛋白，其ABP为Protein G的一部分，氨基酸序列如SEQ ID No.2所示；DFE‑1为DNAse I，氨基酸序列如SEQ ID No.4所示；所述两个结构域通过短的刚性连接肽Linker 1连接，所述短的刚性连接肽Linker 1的氨基酸序列如SEQ ID No.6所示；命名为ABP‑L‑DFE‑2的融合蛋白，其ABP为Protein G的一部分，氨基酸序列如SEQ ID No.2所示；DFE‑2为DNAse I，氨基酸序列如SEQ ID No.4所示；所述两个结构域通过长的刚性连接肽Linker 2连接，长的刚性连接肽Linker 2的氨基酸序列如SEQ ID No.8所示；命名为ABP‑L‑DFE‑3的融合蛋白，其ABP为Protein A的一部分，氨基酸序列如SEQ ID No.10所示；DFE‑3为DNAse I，氨基酸序列同SEQ ID No.4所示；所述两个结构域通过短的刚性连接肽Linker 1连接；所述短的刚性连接肽Linker 1的氨基酸序列同SEQ ID No.6所示；命名为ABP‑L‑DFE‑4的融合蛋白，其ABP为Protein A的一部分，所述Protein A的一部分的编码核苷酸序列同SEQ ID No.9所示；DFE‑4为DNAse I，氨基酸序列同SEQ ID No.4所示；所述两个结构域通过长的刚性连接肽Linker 2连接，所述长的刚性连接肽Linker 2的氨基酸序列同SEQ ID No.8所示；命名为ABP‑L‑DFE‑5的融合蛋白，其ABP为Protein G的一部分，氨基酸序列同SEQ ID No.2所示；DFE‑5为MNase，氨基酸序列如SEQ ID No.12所示；所述两个结构域通过短的刚性连接肽Linker 1连接，所述短的刚性连接肽Linker 1的氨基酸序列同SEQ ID No.6所示；命名为ABP‑L‑DFE‑6的融合蛋白，其ABP为Protein G的一部分，氨基酸序列同SEQ ID No.2所示；DFE‑6为MNase，氨基酸序列同SEQ ID No.12所示；所述两个结构域通过长的刚性连接肽Linker 2连接，所述长的刚性连接肽Linker 2的氨基酸序列同SEQ ID No.8所示；命名为ABP‑L‑DFE‑7的融合蛋白，其ABP为Protein A的一部分，氨基酸序列同SEQ ID No.10所示；DFE‑7为MNase，氨基酸序列同SEQ ID No.12所示；所述两个结构域通过短的刚性连接肽Linker 1连接，所述短的刚性连接肽Linker 1的氨基酸序列同SEQ ID No.6所示；命名为ABP‑L‑DFE‑9的融合蛋白，其ABP为Protein A的一部分，氨基酸序列同SEQ ID No.10所示；DFE‑9为MNase，氨基酸序列同SEQ ID No.12所示；所述两个结构域通过长的刚性连接肽Linker 2连接，所述长的刚性连接肽Linker 2的氨基酸序列同SEQ ID No.8所示；命名为ABP‑L‑DFE‑10的融合蛋白，其ABP为Protein G的一部分，氨基酸序列同SEQ ID No.2所示；DFE‑10为Tn5m，氨基酸序列如SEQ ID No.16所示；所述两个结构域通过短的刚性连接肽Linker 1连接，所述短的刚性连接肽Linker 1的氨基酸序列同SEQ ID No.6所示；命名为ABP‑L‑DFE‑11的融合蛋白，其ABP为Protein G的一部分，氨基酸序列同SEQ ID No.2所示；DFE‑11为Tn5m，氨基酸序列同SEQ ID No.16所示；所述两个结构域通过长的刚性连接肽Linker 2连接，所述长的刚性连接肽Linker 2的氨基酸序列同SEQ ID No.8所示；命名为ABP‑L‑DFE‑12的融合蛋白，其ABP为Protein A的一部分，氨基酸序列同SEQ ID No.10所示；DFE‑12为Tn5m，氨基酸序列同SEQ ID No.16所示；所述两个结构域通过短的刚性连接肽Linker 1连接，所述短的刚性连接肽Linker 1的氨基酸序列同SEQ ID No.6所示；命名为ABP‑L‑DFE‑14的融合蛋白，其ABP为Protein A的一部分，氨基酸序列同SEQ ID No.10所示；DFE‑14为Tn5m，氨基酸序列同SEQ ID No.16所示；所述两个结构域通过长的刚性连接肽Linker 2连接，所述长的刚性连接肽Linker 2的氨基酸序列同SEQ ID No.8所示。