[发明专利]一种山茶属多态性叶绿体基因组微卫星分子标记引物及筛选和甄别近缘种的方法

摘要

本发明属于林业分子生物学技术领域，具体涉及了一种山茶属多态性叶绿体基因组微卫星分子标记引物及筛选和甄别近缘种的方法。基于山茶属物种叶绿体DNA序列微卫星位点相对一致性，针对种间存在变异的特定微卫星位点设计cpSSR引物；提取不同山茶属物种的DNA，与引物混合、扩增、电泳检测；最终获得山茶属多态性叶绿体基因组微卫星分子标记引物16对。甄别近缘种的方法包括：提取浙江红山茶及其近缘种的DNA，采用多态性引物进行毛细管电泳分离，按PCR产物片段分离甄别近缘种。本发明提供的引物筛选方法快速高效，广泛适用于其他具有叶绿体基因组序列信息的植物种属，获得的多态性cpSSR标记可用于山茶属植物的系统分类、近缘种的甄别及遗传多样性分析等研究。

主权项

1.一种山茶属叶绿体微卫星分子标记的多态性引物，其特征在于，包括16对山茶属cpSSR分子标记的多态性引物，其引物信息为：Cc_cpSSR‑04的正向引物如序列表中SEQ ID NO.1所示，Cc_cpSSR‑04的反向引物如序列表中SEQ ID NO.2所示；Cc_cpSSR‑06的正向引物如序列表中SEQ ID NO.3所示，Cc_cpSSR‑06的反向引物如序列表中SEQ ID NO.4所示；Cc_cpSSR‑12的正向引物如序列表中SEQ ID NO.5所示，Cc_cpSSR‑12的反向引物如序列表中SEQ ID NO.6所示；Cc_cpSSR‑13的正向引物如序列表中SEQ ID NO.7所示，Cc_cpSSR‑13的反向引物如序列表中SEQ ID NO.8所示；Cc_cpSSR‑15的正向引物如序列表中SEQ ID NO.9所示，Cc_cpSSR‑15的反向引物如序列表中SEQ ID NO.10所示；Cc_cpSSR‑20的正向引物如序列表中SEQ ID NO.11所示，Cc_cpSSR‑20的反向引物如序列表中SEQ ID NO.12所示；Cc_cpSSR‑22的正向引物如序列表中SEQ ID NO.13所示，Cc_cpSSR‑22的反向引物如序列表中SEQ ID NO.14所示；Cc_cpSSR‑24的正向引物如序列表中SEQ ID NO.15所示，Cc_cpSSR‑24的反向引物如序列表中SEQ ID NO.16所示；Cc_cpSSR‑37的正向引物如序列表中SEQ ID NO.17所示，Cc_cpSSR‑37的反向引物如序列表中SEQ ID NO.18所示；Cc_cpSSR‑40的正向引物如序列表中SEQ ID NO.19所示，Cc_cpSSR‑40的反向引物如序列表中SEQ ID NO.20所示；Cc_cpSSR‑49的正向引物如序列表中SEQ ID NO.21所示，Cc_cpSSR‑49的反向引物如序列表中SEQ ID NO.22所示；Cc_cpSSR‑64的正向引物如序列表中SEQ ID NO.23所示，Cc_cpSSR‑64的反向引物如序列表中SEQ ID NO.24所示；Cc_cpSSR‑65的正向引物如序列表中SEQ ID NO.25所示，Cc_cpSSR‑65的反向引物如序列表中SEQ ID NO.26所示；Cc_cpSSR‑71的正向引物如序列表中SEQ ID NO.27所示，Cc_cpSSR‑71的反向引物如序列表中SEQ ID NO.28所示；Cc_cpSSR‑74的正向引物如序列表中SEQ ID NO.29所示，Cc_cpSSR‑74的反向引物如序列表中SEQ ID NO.30所示；Cc_cpSSR‑75的正向引物如序列表中SEQ ID NO.31所示，Cc_cpSSR‑75的反向引物如序列表中SEQ ID NO.32所示。