[发明专利]基于lncRNA的SCA3/MJD的生物标志物的筛选和鉴定方法在审
申请号: | 201810855813.7 | 申请日: | 2018-07-31 |
公开(公告)号: | CN110777198A | 公开(公告)日: | 2020-02-11 |
发明(设计)人: | 江泓;李天娇;陈召;彭慧蓉;唐北沙 | 申请(专利权)人: | 中南大学湘雅医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883 |
代理公司: | 43218 长沙市标致专利代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 徐邵华 |
地址: | 410008 湖*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | 一种基于lncRNA的SCA3/MJD的生物标志物的筛选和鉴定方法,包括以下步骤:1)准备含脊髓小脑性共济失调3型的抗凝血和不含脊髓小脑性共济失调3型的抗凝血各5~10ml使用淋巴细胞分离液分离外周血单个核细胞;2)提取含lncRNA的总RNAs;3)对总RNAs样本进行高通量测序和生物信息学分析,挑选出组间差异表达的lncRNAs;4)对筛选得到的lncRNAs,进行qRT‑PCR验证,并对其进行Wilcoxon秩和检验,筛选得到SCA3/MJD生物标志物lncRNAs。该筛选方法操作简单,筛选效率高,有效筛选出6个lncRNAs为SCA3/MJD生物标志物,且有助于扩充和完善lncRNA的表达谱。 | ||
搜索关键词: | 筛选 生物标志物 脊髓小脑性共济失调 抗凝血 总RNAs 外周血单个核细胞 淋巴细胞分离液 生物信息学分析 高通量测序 有效筛选 组间差异 表达谱 样本 检验 | ||
【主权项】:
1.一种基于lncRNA的SCA3/MJD的生物标志物的筛选和鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:/n1)准备含脊髓小脑性共济失调3型的抗凝血和不含脊髓小脑性共济失调3型的抗凝血各5~10ml,离心分离得到的血清再次分离得到外周血单个核细胞,低温冷冻备用;/n2)提取步骤1)外周血单个核细胞中含lncRNA的总RNAs;/n3)对步骤2)的总RNAs样本进行高通量测序和生物信息学分析,挑选出组间差异表达的lncRNAs;/n4)对步骤3)筛选得到的lncRNAs,进行qRT-PCR验证,并对其进行Wilcoxon秩和检验,筛选得到SCA3/MJD生物标志物lncRNAs。/n
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