[发明专利]一种引起大豆根腐病的镰孢菌属菌种的鉴定与区分方法在审
| 申请号： | 201810342128.4 | 申请日： | 2018-04-17 |
| 公开（公告）号： | CN108277296A | 公开（公告）日： | 2018-07-13 |
| 发明（设计）人： | 刘世名;郑娜;张刘萍;彭德良 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院植物保护研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12Q1/04 |
| 代理公司： | 北京兆君联合知识产权代理事务所(普通合伙) 11333 | 代理人： | 胡敬红 |
| 地址： | 100193 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种引起大豆根腐病的镰孢菌属菌种的鉴定与区分方法。根据形态学与用ITS序列构建的遗传进化树鉴定结果，根据扩增的ITS序列长度，用3％琼脂糖凝胶电泳将茄病镰孢菌和其它3类镰孢菌分开；比对剩下的3类镰孢菌ITS序列，找出特异性限制性内切酶的酶切位点BspCNI，AvaI及PstI；用这3种酶的不同组合酶解扩增的ITS序列，形成不同的CAPS分子标记，用1.5％琼脂糖凝胶电泳分离，从而将这3类镰孢菌区分开。镰孢菌属中菌种鉴定与区分仅借助琼脂糖凝胶电泳与CAPS分子标记就可实现，该方法适应于大规模、高通量的菌种鉴定与区分，尤其适用于我国大豆产区引起大豆根腐病的主要镰孢菌的快速鉴定与区分。 | ||
| 搜索关键词： | 镰孢菌 琼脂糖凝胶电泳 大豆根腐病 镰孢菌属 菌种鉴定 扩增 菌种 形态学 特异性限制性 鉴定结果 快速鉴定 酶切位点 茄病镰孢 我国大豆 遗传进化 组合酶解 高通量 内切酶 比对 构建 | ||
【主权项】：
1.一种引起大豆根腐病的镰孢菌属菌种的区分与鉴别方法，包括如下顺序步骤：(1)通过形态学特征鉴定为镰孢菌属，(2)PCR扩增镰孢菌ITS序列，琼脂糖凝胶电泳得到不同长度的ITS序列；(3)比对不同种类镰孢菌的ITS序列，找出特异性限制性内切酶位点，用不同酶组合酶解扩增的ITS序列，形成不同的CAPS分子标记，琼脂糖凝胶电泳分离，得到各镰孢菌不同的电泳分离模式，从而区分镰孢菌属不同菌种。
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