[发明专利]一种基于DBN算法的药物靶向蛋白作用预测方法

摘要

本发明公开了一种基于DBN算法的药物靶向蛋白作用预测方法，该方法是从药物的分子结构出发，提取药物的扩展连通指纹，从蛋白质的氨基酸序列出发，提取了蛋白质的三肽结构特征，将药物的扩展连通指纹和蛋白质的三肽结构特征两两拼接，构造成一个药物－蛋白质特征向量，之后输入到深度置信网络中进行训练，网络的输出为网络输入的药物－蛋白质对发生相互作用的概率，最后选择合适的阈值判断这一对关联是否成立。本发明能够使得在没有人工干预的情况下，较快速地给出药物‑靶向蛋白可能的相互作用对，从而节省药物研发试验成本，加快了药物新功能的挖掘和发现。

主权项

1.一种基于DBN算法的药物靶向蛋白作用预测方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、计算药物的扩展连接连通指纹特征和蛋白质的氨基酸序列的三肽结构特征，并将两者串接起来；S2、基于受限波尔兹曼机远离对深度置信网络的各层参数进行预训练；S3、利用反向传播算法对整个网络的参数进行微调；S4、对测试数据进行作用预测。