[发明专利]一种基于核心系谱品种的高密度分子标记辅助聚合育种方法

摘要

本发明公开一种基于核心系谱品种的高密度分子标记辅助聚合育种方法。本发明利用高密度分子标记的分型结果，结合核心系谱品种重要性状(如抗逆、品质、产量等)相关的标记和基因组区段信息，构建核心系谱品种为主体，引入其他品种优良基因和性状的杂交育种策略，通过整合现有的优质品种资源，实现快速定向育种。本发明的方法极大减少了选种的盲目性和随机性，提高育种效率、降低育种成本；以全基因组高密度SNP标记进行辅助选择，提高了选择效率；同时，获得的衍生品种表型信息和遗传信息，也方便了后续的聚合育种。在聚合育种过程中，随着更多优质种质资源的引入，不断优化和改进最优片段组合模型，加速培育聚合更多优势基因和片段的品种。

主权项

1.一种基于核心系谱品种的高密度分子标记辅助聚合育种方法，其特征在于包括如下步骤：（1）核心系谱品种和需要引入的外源品种进行重测序或SNP芯片检测，得到SNP分型结果；（2）利用分型结果，结合性状关联的基因组区段信息，分析确定核心系谱品种需要引入的外源片段信息；（3）将核心系谱品种与需要引入的外源品种杂交，获得F1代；（4）F2群体大批量种植，F2群体先利用步骤（2）确定的外源片段内部SNP标记对F2进行筛选，筛选出尽可能多的包含外源片段的F2单株，接着根据表型进行进一步筛选出偏向某一亲本或具有某些表型值的F2单株；或者先根据表型筛选出偏向某一亲本或具有某些表型值的F2单株，再利用步骤（2）确定的外源片段内部SNP标记对F2进行筛选，筛选出尽可能多的包含外源片段的F2单株，具体操作根据资金与育种目标和条件而定；（5）步骤（4）筛选后的F2单株不断进行自交，在这个过程中根据表型不断保留优质株，直至优良性状稳定；（6）根据表型挑选优质株，进行重测序或SNP芯片基因分型，以核心系谱品种为参考进行染色体片段来源分析，保留遗传背景与核心系谱品种最接近的3～5株结果，再经过1～2代的田间选择和表型考察，选育出1个株系成为自交系品种；（7）重复步骤（1）～（6），通过核心系谱品种与众多优良品种进行杂交、自交、筛选，得到一系列以核心系谱品种为主要遗传背景的自交系品种；（8）整合利用步骤（7）得到的一系列以核心系谱品种为主要遗传背景的自交系品种，进行聚合育种，实现快速定向育种，培育优良品种；（9）对于亲缘关系较接近、农艺性状差异不大的品种，在步骤（2）时先将需要引入的外源品种杂交，在F1′代或高世代通过与核心系谱品种复交将外源片段引入，再进行步骤（3）～（6）即实现多基因快速聚合，培育优良品种；所述的核心系谱品种为水稻核心系谱品种。