[发明专利]一种提高目的基因在宿主体内表达水平的密码子优化方法在审
| 申请号： | 201810030102.6 | 申请日： | 2018-01-12 |
| 公开（公告）号： | CN110423769A | 公开（公告）日： | 2019-11-08 |
| 发明（设计）人： | 左永春;贾雪琦;赵小庆 | 申请（专利权）人： | 内蒙古大学 |
| 主分类号： | C12N15/67 | 分类号： | C12N15/67 |
| 代理公司： | 北京华仲龙腾专利代理事务所(普通合伙) 11548 | 代理人： | 李静 |
| 地址： | 010000 内蒙古自*** | 国省代码： | 内蒙古;15 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种提高目的基因在宿主体内表达水平的密码子优化方法，包括以下步骤：第一步，对目的基因和宿主基因组的密码子进行密码子偏爱性分析；第二步，比较并总结密码子使用差异，找出可能的限速密码子；第三步，将目的基因编码序列中的限速密码子进行替换优化；第四步，编码序列前后分别连接宿主管家基因的5’UTR和3’UTR；第五步，对起始密码子上游30bp附近的碱基进行优化；第六步，对DNA甲基化寡片段进行优化；第七步，排除优化后目的基因中的常见限制性内切酶位点；第八步，对优化结果表达水平进行预测。本发明的优化方法能提高目的基因在宿主内的表达水平。 | ||
| 搜索关键词： | 目的基因 宿主 密码子 优化 密码子优化 编码序列 表达水平 体内表达 限速 限制性内切酶位点 密码子偏爱性 密码子使用 起始密码子 宿主基因组 管家基因 优化结果 碱基 替换 上游 预测 分析 | ||
【主权项】：
1.一种提高目的基因在宿主体内表达水平的密码子优化方法，其特征在于，包括以下步骤：第一步，对目的基因和宿主基因组的密码子进行密码子偏爱性分析；第二步，比较并总结密码子使用差异，找出可能的限速密码子；第三步，将目的基因编码序列中的限速密码子进行替换优化；第四步，编码序列前后分别连接宿主管家基因的5’UTR和3’UTR；第五步，对起始密码子上游30bp附近的碱基进行优化；第六步，对DNA甲基化寡片段进行优化；第七步，排除优化后目的基因中的常见限制性内切酶位点；第八步，对优化结果表达水平进行预测。
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