[发明专利]ctDNA甲基化建库的标签接头、引物组、试剂盒和建库方法在审
| 申请号： | 201711449169.5 | 申请日： | 2017-12-27 |
| 公开（公告）号： | CN108103060A | 公开（公告）日： | 2018-06-01 |
| 发明（设计）人： | 伍泳彰;陈杰 | 申请（专利权）人： | 广州赛哲生物科技股份有限公司 |
| 主分类号： | C12N15/11 | 分类号： | C12N15/11;C12N15/10;C40B50/06 |
| 代理公司： | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人： | 单香杰 |
| 地址： | 510320 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明属于分子基因组学技术领域，具体公开了一种用于ctDNA甲基化建库的标签接头、引物组、试剂盒和建库方法。所述标签接头包括上游双链标签接头A和下游双链标签接头P1；所述引物组由上游扩增引物和下游扩增引物组成；所述试剂盒包括所述标签接头和引物组；所述建库方法包括ctDNA提取、重亚硫酸盐转化及纯化、末端修复、接头连接、文库扩增和上机测序等步骤。本发明设计了144种标签序列，可满足同时操作上百个样品的需求，为批量建库提供充足的标签接头。本发明所提供的建库方法有较好的兼容性，适用于常见的二代测序平台；操作灵活简便，具有检测灵敏度高、高效快捷、节约成本的优点，有较好的应用推广前景。 | ||
| 搜索关键词： | 建库 标签 引物组 试剂盒 甲基化 双链 上游扩增引物 下游扩增引物 检测灵敏度 重亚硫酸盐 标签序列 测序平台 基因组学 接头连接 末端修复 兼容性 接头A 测序 扩增 上机 文库 节约 上游 灵活 转化 应用 | ||
【主权项】：
1. 一种用于ctDNA甲基化建库的标签接头，其特征在于，包括由单链正向序列A-BN-Forward和单链反向序列A-BN-Reverse组成的上游双链标签接头A以及由单链正向序列P1-Forward和单链反向序列P1-Reverse组成的下游双链标签接头P1，其核苷酸序列依次如SEQID NO:1～SEQ ID NO:4所示；所述上游双链标签接头A中的M和V代表由10～12个碱基组成的标签序列Barcode；其中，M的核苷酸序列选自SEQ ID NO:5～SEQ ID NO:148中的任意一条，V为M的互补序列。
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