[发明专利]一种在27个群体中识别中国青藏高原藏族群体个体的方法和系统

摘要

本发明提供一种在27个群体中识别中国青藏高原藏族群体个体的方法和系统，所述方法包括提取个体的DNA；获得所述DNA的87个藏族特异高原适应SNP位点的基因型；将所述各特异性位点的基因型利用STRUCTURE软件获得所述个体的群体遗传成分分析结果，根据该结果识别该个体是否为中国青藏高原藏族群体个体。本发明提供的方案能将个体在27个群体中识别为中国青藏高原藏族群体个体或非中国青藏高原藏族群体个体。本发明的方案能增加针对东亚亚人群的分辨率，可为相关案件提供侦破线索。

主权项

一种在27个群体中识别中国青藏高原藏族群体个体的方法，其特征在于，该方法包括：1)提取个体的DNA；2)获得所述DNA的87个藏族特异高原适应SNP位点的基因型，所述87个藏族特异高原适应SNP位点为：rs10178633、rs10193827、rs10206434、rs1109285、rs1109286、rs11122280、rs11125068、rs115321619、s116062164、rs116611511、rs11675232、rs11675441、rs11689011、rs11805033、rs12467821、rs13003074、rs13006131、rs13419896、rs13424253、rs1374749、rs141366568、rs141426873、rs142826801、rs1447563、rs149306391、rs150877473、rs1562453、rs17034950、rs17035010、rs17035013、rs1867784、rs1868092、rs1992846、rs2066140、rs2121266、rs2153364、rs2244986、rs2275279、rs2486729、rs2486736、rs2486745、rs2491412、rs2739506、rs2739513、rs2790880、rs2790882、rs2808611、rs3088359、rs369097672、rs3768729、rs4450662、rs480902、rs4953342、rs4953343、rs4953353、rs4953354、rs4953357、rs4953359、rs4953360、rs4953372、rs55981512、rs58160876、rs61151542、rs6679627、rs6712143、rs6715787、rs6756667、rs73926263、rs73926264、rs73926265、rs74898705、rs7534248、rs7565341、rs7571218、rs7582701、rs7583088、rs7583392、rs7583554、rs7586141、rs7589621、rs7590087、rs7594278、rs76347095、rs78569471、rs9679290、rs982414以及rs9973653；3)将所述各特异性位点的基因型利用STRUCTURE软件获得所述个体的群体遗传成分分析结果，根据该结果识别该个体是否为中国青藏高原藏族群体个体；所述27个群体为冈比亚西部人群、塞拉利昂的门德人群、尼日利亚伊巴丹的约鲁巴人群、肯尼亚卢西亚人群、尼日利亚艾森人群、美国西部黑人群、加勒比海巴巴多斯岛人群、秘鲁利马人群、哥伦比亚麦德林的哥伦比亚人群、波多黎各人群、美国洛杉矶的墨西哥人群、美国犹他州的北欧和西欧后裔、芬兰的芬兰人群、苏格兰和英格兰的英国人群、西班牙的伊比利亚人群、意大利的塔斯卡尼亚人群、孟加拉的孟加拉人群、巴基斯坦的旁遮普人群、德克萨斯州休斯顿的古吉拉特语系印度人群、英国的印度泰卢固人群、英国的斯里兰卡泰米尔人群、日本东京地区的日本人群、中国北京汉族人群、中国南方汉族人群、越南京族人群、中国西双版纳傣族人群以及中国青藏高原藏族人群。