[发明专利]基因组隔离子的高通量鉴定方法有效
申请号: | 201710659482.5 | 申请日: | 2017-08-04 |
公开(公告)号: | CN107604043B | 公开(公告)日: | 2019-04-16 |
发明(设计)人: | 侯春晖;牛龙见;张越东;何娜;孙加雷;黄盈长 | 申请(专利权)人: | 南方科技大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 唐致明 |
地址: | 518055 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了基因组隔离子的高通量鉴定方法,包括:1)构建报告载体:报告载体依次具有启动子、ORF区、内含子和隔离子候选序列插入区和增强子;增强子用于增强上游序列的表达,隔离子候选序列插入区插入有隔离子候选序列;2)将报告载体表达转录;3)检测转录序列的编辑后转录情况,确定隔离子候选序列是否为隔离子。该方法构建的报告载体库可以覆盖90%到99%的基因组非编码区,不需要蛋白位置信息,全部分析;将所构建的库转入细胞内,可以同时检测几乎整个基因组序列是否具有隔离子活性,可以大规模并行分析,避免单个、少量的分析;因为所构建库覆盖几乎所有位点,因此未知区域同样可以被检测分析。 | ||
搜索关键词: | 隔离子 报告载体 候选序列 构建 高通量鉴定 转录 插入区 基因组 增强子 基因组非编码区 大规模并行 基因组序列 蛋白位置 检测分析 上游序列 转录序列 分析 内含子 启动子 检测 覆盖 位点 转入 细胞 | ||
【主权项】:
1.一种鉴定基因组隔离子的方法,包括:1)构建报告载体:报告载体依次具有启动子、ORF区、内含子、隔离子候选序列插入区、RNA稳定序列和增强子;增强子用于增强上游序列的表达,隔离子候选序列插入区插入有隔离子候选序列;2)将报告载体表达转录;3)检测转录序列的编辑后转录情况,确定隔离子候选序列是否为隔离子。
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