[发明专利]基于计算云平台的真核无参转录组交互分析系统及其方法在审
申请号: | 201710598315.4 | 申请日: | 2017-07-21 |
公开(公告)号: | CN107391963A | 公开(公告)日: | 2017-11-24 |
发明(设计)人: | 刘彬旭;余果;郭权;任一;史彩萍;曾静;石今;周玄 | 申请(专利权)人: | 上海桑格信息技术有限公司 |
主分类号: | G06F19/20 | 分类号: | G06F19/20;G06F19/26 |
代理公司: | 上海恒锐佳知识产权代理事务所(普通合伙)31286 | 代理人: | 黄海霞 |
地址: | 201321 上海市浦*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于计算云平台的真核无参转录组交互分析系统及其方法,该系统包括项目管理模块、基础分析任务提交模块和交互式结果分析模块;首先,向本地集群服务器上传测序数据,在项目管理模块中建立项目,同时在本地集群服务器上传客户的数据库或者选择使用线上的数据库,并且在该项目管理模块中可以进行项目锁定或者共享给他人操作;然后,在基础分析任务提交模块中,用户可以通过可视化界面对测序数据进行参数分析,分析之后产生项目文件;分析之前,先进行判定数据质控是否合格,若合格则进行参数分析;若不合格则直接返回报错;产生的项目文件传送至交互式结果分析模块中进行交互式分析,得到直观呈现的报告。 | ||
搜索关键词: | 基于 计算 平台 真核无参 转录 交互 分析 系统 及其 方法 | ||
【主权项】:
一种基于计算云平台的真核无参转录组交互分析系统,其特征在于:包括项目管理模块,用于对项目信息进行查看和管理,通过项目、任务、应用和文件对所有状态的分析项目进行综合管理;基础分析任务提交模块,用于设置基础参数运行任务,并将结果以及原始数据按照预设格式整合封装成相应的项目文件,基础参数运行任务包括测序数据质控、转录组拼接、基因功能注释、表达量分析和基因结构分析;交互式结果分析模块,用于根据用户请求生成分析结果,并将结果可视化展示,包括高级生物信息学分析和个性化生物信息学分析;所述项目管理模块通过基础分析任务提交模块与交互式结果分析模块相连接。
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G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
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G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
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