[发明专利]一种基于单核苷酸多态性的葡萄球菌种水平鉴定和菌株分型一体化方法

摘要

本发明公开了一种葡萄球菌种水平鉴定和菌株分型一体化的方法，以及用于鉴定和分型的靶基因和引物组合物，该方法具体包括待检菌株DNA提取、靶基因PCR扩增、核酸测序、序列比对和聚类分析等步骤。基于该方法，建立常见葡萄球菌靶基因序列数据库，将待检菌株靶基因序列与数据库标准序列进行比对和聚类分析，对葡萄球菌进行种水平鉴定和菌株分型。本发明所述的葡萄球菌种水平鉴定和菌株分型一体化方法，具有通用性高、鉴定准确和分辩力强等优点，且操作简单、快速有效，为葡萄球菌鉴定分型一体检测提供了新的技术平台，可用于药品质量监管单位、药品生产企业，对葡萄球菌种水平鉴定和菌株分型溯源，具有广阔市场前景和较大的经济、社会效益。

主权项

一种用于葡萄球菌种水平鉴定和菌株分型的引物组合物，其特征在于，包括：femA引物对：由SEQ ID NO：7‑SEQ ID NO：8所示序列组成；ftsZ引物对：由SEQ ID NO：9‑SEQ ID NO：10所示序列组成；gap引物对：由SEQ ID NO：11‑SEQ ID NO：12所示序列组成；pyrH引物对：由SEQ ID NO：13‑SEQ ID NO：14所示序列组成；rpoB引物对：由SEQ ID NO：15‑SEQ ID NO：16所示序列组成；和tufA引物对：由SEQ ID NO：17‑SEQ ID NO：18所示序列组成。