[发明专利]一种用于紫斑牡丹与中原牡丹的分子鉴定方法在审
申请号: | 201710444509.9 | 申请日: | 2017-06-13 |
公开(公告)号: | CN107164498A | 公开(公告)日: | 2017-09-15 |
发明(设计)人: | 唐红;丑欢欢 | 申请(专利权)人: | 甘肃农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司11385 | 代理人: | 董芙蓉 |
地址: | 730070 甘肃省*** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | 本发明公开了一种用于紫斑牡丹与中原牡丹的分子鉴定方法,该方法包括以下步骤对待鉴定样品进行DNA提取;PCR扩增;序列校正、比对;序列分析。本发明通过实验研究发现,紫斑牡丹的matK序列在第31bp和79bp两个位点处与所有中原牡丹序列发生差异,是最保守的2个差异位点,故这两个位点可作为鉴定紫斑牡丹和中原牡丹的信息位点。基于以上发现,本发明提供了matK序列作为DNA条形码在鉴定紫斑牡丹中的应用。 | ||
搜索关键词: | 一种 用于 紫斑 牡丹 中原 分子 鉴定 方法 | ||
【主权项】:
一种用于紫斑牡丹与中原牡丹的分子鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)对待鉴定样品进行DNA提取;(2)PCR扩增以步骤(1)提取的总DNA为模板,分别用matK序列的正向和反向引物进行扩增,P1 5’‑CCTATATCCGCTACTCCTTC‑3’和P2 5’‑CTCAGTGAATTTCACCACG‑3’,分别得到扩增产物;(3)序列校正、比对将来自GeneBank的紫斑牡丹matK序列AF033592.1与所有扩增后的样品序列,经过人工校正、对齐并除去引物区及测序质量较差区域的片段,最终获得干净、长度一致的序列进行比对;(4)序列分析利用MEGA5.05分析序列间的变异位点。
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