[发明专利]一个棉花品质性状关联的编码肌球蛋白的基因

摘要

本发明属于生物技术应用领域，涉及一个棉花纤维品质性状关联的肌球蛋白编码基因(GhXIK)。本发明提供了该基因在四倍体陆地棉中的cDNA序列SEQ ID NO.1和基因组序列SEQ ID NO.2。本发明提供的基因由棉花品种重测序和全基因组关联分析所得，同时与纤维伸长率、长度、强度和整齐度这四个品质性状显著关联。利用该基因的非同义SNP位点来区分陆地棉品种高品质和低品质单倍型。根据这两种单倍型对品种群体进行归类，并结合品质性状进行统计分析，同样证明GhXIK与棉花纤维品质性状之间存在显著的相关性。本项目同时提供了一种用于检测所述的SNP位点的引物对，上游引物为：SEQ ID NO.3，下游引物为：SEQ ID NO.4。以上结果说明该基因在高效鉴定高品质陆地棉品种、改良棉花品质性状和培育棉花高纤维品质新品种中具有重要的研究价值和应用前景。

主权项

肌球蛋白编码基因GhXIK，其特征在于在所述的肌球蛋白编码基因GhXIK在四倍体陆地棉TM‑1中的cDNA序列为：SEQ ID NO.1，基因组序列为：SEQ ID NO.2；所述的肌球蛋白编码基因GhXIK含有一个非同义突变的SNP位点，在cDNA序列3032bp或者基因组序列的8714bp位置上,该SNP位点碱基从野生型的C变为T，对应的氨基酸由野生型的Ala变为Vla；突变后的基因型纤维长度、强度和整齐度显著优于野生型。