[发明专利]一种隆头鱼类群线粒体基因组测定的方法

摘要

本发明涉及鱼类的分子生物学技术领域，具体地说，是一种隆头鱼类群线粒体基因组测定的方法。本发明提供的方法，包括以下步骤：(1)获得16S rRNA、CO1和Cytb基因的部分序列；(2)获得16S rRNA至CO1的间隔区序列、tRNA‑Leu至Cytb的间隔区序列和Cytb至16S rRNA的间隔区序列；(3)获得CO1至tRNA‑Leu间隔区的序列；(4)对步骤(1)、(2)和(3)中获得的序列进行拼接，获得隆头鱼mtDNA基因组全序列。本发明的有益效果是高效简洁的隆头鱼类群线粒体全基因组序列测定的方法。

主权项

一种隆头鱼类群线粒体基因组测定的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)获得16S rRNA、CO1和Cytb基因的部分序列：选择鱼类mtDNA的3个基因16S rRNA、CO1和Cytb的序列，相应的各自设计1对引物，名称分别为16S、CO1和Cytb，以隆头鱼DNA为模板，进行PCR扩增，扩增产物直接测序，分别获得16S rRNA、CO1和Cytb基因的部分序列；(2)获得16S rRNA至CO1的间隔区序列、tRNA‑Leu至Cytb的间隔区序列和Cytb至16S rRNA的间隔区序列：将步骤(1)中获得的16S rRNA、CO1和Cytb基因的部分序列，以及公布的mtDNA的tRNA‑Leu的序列设计引物，实现引物对SC扩增16S rRNA至CO1的间隔区序列；引物对LY扩增tRNA‑Leu至Cytb的间隔区序列；引物对YS扩增Cytb至16S rRNA的间隔区序列；(3)获得CO1至tRNA‑Leu间隔区的序列：根据步骤(1)中获得的CO1基因的部分序列和步骤(2)中获得的tRNA‑Leu至Cytb的间隔区的序列，设计引物对CL，实现扩增CO1至tRNA‑Leu间隔区的序列；(4)对步骤(1)、(2)和(3)中获得的序列进行拼接，获得隆头鱼mtDNA基因组全序列。