[发明专利]陆地棉25号染色体与纤维强度相关的SNP分子标记有效

专利信息
申请号: 201710097667.1 申请日: 2017-02-22
公开(公告)号: CN107043813B 公开(公告)日: 2021-09-07
发明(设计)人: 商海红;巩万奎;范森淼;张震;袁有禄;石玉真;吴东;葛群;刘爱英;龚举武;李俊文 申请(专利权)人: 中国农业科学院棉花研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 北京知本村知识产权代理事务所(普通合伙) 11039 代理人: 刘江良
地址: 455000 河*** 国省代码: 河南;41
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摘要: 陆地棉25号染色体与纤维强度相关的SNP分子标记。本发明属于棉花分子育种技术领域,公开了一种与陆地棉纤维强度相关的SNP分子标记及其检测和应用。所述的SNP分子标记是以棉花稳定的RIL群体为材料,通过基因组重测序的方法得到。利用本发明所公开的这些SNP标记,进行分子标记辅助育种选择,可大大缩短育种周期,提高棉花纤维强度的育种效率。
搜索关键词: 陆地棉 25 染色体 纤维 强度 相关 snp 分子 标记
【主权项】:
一种与棉花纤维高强度基因连锁的SNP分子标记,其定位在与纤维强度相关的5个QTL中,其中有4个在多环境下检测稳定,这些QTL都位于陆地棉25号染色体上,有3个能够筛选得到分型较好的SNP标记,其中与qFS‑chr25‑2连锁的SNP标记为CRI‑SNP198784、CRI‑SNP198785、CRI‑SNP198786、CRI‑SNP198787、CRI‑SNP198788、CRI‑SNP198789、CRI‑SNP198790、CRI‑SNP198791;与qFS‑chr25‑3连锁的SNP标记为CRI‑SNP198792、CRI‑SNP198793、CRI‑SNP198794、CRI‑SNP198795;与qFS‑chr25‑5连锁的SNP标记为CRI‑SNP198796、CRI‑SNP198797、CRI‑SNP198798、CRI‑SNP198799、CRI‑SNP198800、CRI‑SNP198801、CRI‑SNP198802、CRI‑SNP198803、CRI‑SNP198804、CRI‑SNP198805、CRI‑SNP198806、CRI‑SNP198807,其特征在于:所述的SNP分子标记在染色体上的位置和突变碱基如下表所示:标记名称SNP位点突变碱基CRI‑SNP19878411634304G/TCRI‑SNP19878511727497G/TCRI‑SNP19878611727737G/TCRI‑SNP19878711800162G/ACRI‑SNP19878811800115G/TCRI‑SNP19878912039916G/ACRI‑SNP19879012039883C/TCRI‑SNP19879112364008T/CCRI‑SNP19879213627793C/TCRI‑SNP19879313795574G/TCRI‑SNP19879413627853T/CCRI‑SNP19879513795623C/TCRI‑SNP19879615620852G/ACRI‑SNP19879716378403T/CCRI‑SNP19879817002845C/TCRI‑SNP19879916735882G/ACRI‑SNP19880016727879C/ACRI‑SNP19880116548321G/TCRI‑SNP19880217481142G/CCRI‑SNP19880317882165T/CCRI‑SNP19880418212914G/ACRI‑SNP19880518213630A/CCRI‑SNP19880618213276G/ACRI‑SNP19880719698812C/G                                                                        。
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