[发明专利]一种用于检测内部串联重复的装置有效
| 申请号： | 201710067187.0 | 申请日： | 2017-02-07 |
| 公开（公告）号： | CN106845155B | 公开（公告）日： | 2021-11-16 |
| 发明（设计）人： | 李停;侯光远;刘伟;方真;玄兆伶;李大为;梁峻彬;陈重建 | 申请（专利权）人： | 安诺优达基因科技（北京）有限公司;浙江安诺优达生物科技有限公司;安诺优达（义乌）医学检验有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 100176 北京市北京经济技*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种用于检测ITD的装置，其包括测序数据获取模块、比对模块、区分模块、模式比对模块、真实ITD判断模块、以及输出模块。本发明的用于检测ITD的装置具有检测速度快、资源要求低、稳定性高的优点。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 用于 检测 内部 串联 重复 装置 | ||
【主权项】：
一种用于检测ITD的装置，其包括以下模块：测序数据获取模块，用于获取测序数据；比对模块：其与所述测序数据获取模块相连接，用于将获取的测序数据与参考序列进行比对，获取测序片段在基因中对应的位置；区分模块：其与所述比对模块相连接，用于区分可能发生ITD的测序片段和不可能发生ITD的测序片段；模式比对模块，其与所述区分模块相连接，用于对于可能发生ITD的测序片段，根据其soft‑clipping的模式，向前或向后进行比对；真实ITD判断模块：其与所述模式比对相连接，用于判断所述可能发生ITD的测序片段是否真实发生了ITD；以及输出模块：其与所述真实ITD判断模块相连接，用于输出ITD检测结果。
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