[发明专利]生物数据模式识别的多级体系构架在审
申请号: | 201680048013.3 | 申请日: | 2016-08-12 |
公开(公告)号: | CN107924430A | 公开(公告)日: | 2018-04-17 |
发明(设计)人: | K·沃良斯基;N·迪米特罗娃 | 申请(专利权)人: | 皇家飞利浦有限公司 |
主分类号: | G06F19/24 | 分类号: | G06F19/24 |
代理公司: | 永新专利商标代理有限公司72002 | 代理人: | 王英,刘炳胜 |
地址: | 荷兰艾*** | 国省代码: | 暂无信息 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 公开了用于检测至少一个生物体的成分中的模式的方法、系统和装置。根据一种方法,通过选择(210)基因或蛋白质中的至少一个的不同子集并且从对应于所选择的子集的生物数据中识别(212)聚类来确定(208)成分的聚类。这里,计算针对所述成分的隶属度值,所述隶属度值指示在聚类内的隶属度,以用作额外的聚类确定过程(208)的基础以获得最终的成分聚类。通过使初步聚类基于生物数据的不同子集以及基于隶属度值来制定更高级聚类,实施例使得能够以实用的、准确的并且高效的方式来评估大量生物数据。 | ||
搜索关键词: | 生物 数据 模式识别 多级 体系 构架 | ||
【主权项】:
一种用于检测至少一种生物体的成分中的模式的系统(100),所述系统由至少一个硬件处理器来实现并且包括:数据预处理器(110),其被配置为从所述至少一种生物体的所述成分的基因组或蛋白质组数据中的至少一种汇编第一特征数据集;以及聚类模块(112),其被配置为选择基因或蛋白质中的至少一种的不同子集,并且根据所述第一特征数据集中与选择的所述子集相对应的部分来识别所述成分的聚类,其中,所述聚类模块还被配置为计算针对所述成分的隶属度值,所述隶属度值指示在所述聚类内的隶属度,并且执行额外的聚类确定过程以获得成分的最终聚类,其中,所述额外的聚类确定过程基于所述隶属度值来对所述成分进行聚类。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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