[发明专利]一种芋疫霉菌巢式PCR检测引物及其应用有效
申请号: | 201611084388.3 | 申请日: | 2016-11-30 |
公开(公告)号: | CN106381341B | 公开(公告)日: | 2020-01-17 |
发明(设计)人: | 兰成忠;吴玮;阮宏椿;姚锦爱 | 申请(专利权)人: | 福建省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6848;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 11465 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) | 代理人: | 崔自京 |
地址: | 350013 福建省福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | 本发明公开了一种芋疫霉菌( | ||
搜索关键词: | 一种 霉菌 pcr 检测 引物 及其 应用 | ||
【主权项】:
1.一种芋疫霉菌巢式PCR检测方法,其特征在于,包括以下具体步骤:/n(1)提取待测样品基因组DNA;/n(2)巢式PCR第1轮扩增:所用引物为:/nph1F:5′-CGACCATTGGCGTGGACTTT-3′,/nYph2R:5′-ACGTTCTCGCAGGCGTATCT-3′;/n以步骤(1)提取的DNA为模板,利用Ypt1基因通用引物对ph1F/Yph2R进行第1轮PCR扩增;/nPCR反应体系25L:2×TaqPCRMasterMix12.5L,10mol/L的ph1F/Yph2R引物各1.0L,DNA模板1.0L,用无菌超纯水补足至25L;/nPCR反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性1min、58℃退火30S、72℃延伸1min,35个循环,最后72℃延伸10min;/n(3)巢式PCR第2轮PCR扩增:所用引物对为:/nPCOF:5′-AAGAGGTCCTGTGAGGTTCAA-3′,/nPCOR:5′-AATCTCATGCAGCCACTGCT-3′,/n待步骤(2)第一轮PCR扩增结束后,取1.0μl第一轮PCR扩增产物稀释1-100倍为模板;/nPCR反应体系25L:2×TaqPCRMasterMix12.5L,10mol/L的PCOF/PCOR引物各1.0L,DNA模板1.0L,用无菌超纯水补足至25L;/nPCR条件为:扩增参数为95℃预变性5min,94℃变性30s,58℃退火45s,72℃延伸30s,共35个循环,最后72℃延伸10min;/n(4)凝胶电泳检测:取5.0L步骤(3)第2轮PCR扩增产物用1.5%琼脂糖凝胶进行电泳分离,电压为4-5V/cm,电泳40min后经溴化乙锭染色于紫外灯下观察,根据扩增产物的有无及其片段大小对结果进行判断,如果能特异性地扩增出327bp的产物,即可判断所述的检测样品中存在芋疫霉菌;若无特异性条带则说明样品中无芋疫霉菌。/n
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