[发明专利]一种Keap1 Kelch区多位点分子对接筛选食源性抗氧化寡肽的方法

摘要

本发明公开了一种Keap1Kelch区多位点分子对接筛选食源性抗氧化寡肽的方法，其方法为：步骤一、构建食源性寡肽分子结构库；步骤二、寻找相互作用的PDB文件；步骤三、设计3个结合位点；步骤四、在步骤三中所设计的3个结合位点上进行分子对接；步骤五、综合评价，初步筛选出食源性抗氧化寡肽。有益效果：通过设计多个结合位点，减少由于寡肽比包含ETGE序列的Nrf2片段小而造成的对对接试验的影响。后续试验还能以筛选得到的食源性寡肽为蓝本，利用体外化学试验和细胞试验逐次筛选出具有抗氧化功能的食源性寡肽，从而有效提高试验的效率，减少试验周期。

主权项

一种Keap1 Kelch区多位点分子对接筛选食源性抗氧化寡肽的方法，其特征在于：其方法如下所述：步骤一、从Uniprot数据库中获得食源性蛋白的蛋白质一级结构，并以此为依据，构建食源性寡肽分子结构库；步骤二、从PDB数据库中寻找能反映Keap1蛋白Kelch区与包含ETGE序列的Nrf2片段相互作用的PDB文件；步骤三、分别以该PDB文件的Nrf2结合Keap1的结合位点、离Nrf2片段过近接触的Keap1上所有氨基酸残基和Nrf2片段关键位置ETGE序列这三个标准为参考，设计3个结合位点；步骤四、以寡肽分子结构库的所有寡肽为配体，以PDB文件中Keap1蛋白Kelch区为受体，在步骤三中所设计的3个结合位点上进行分子对接；步骤五、以结合能力为指标评价对接结果，比较并分析结合能力靠前的寡肽配体与活性中心的相互作用与PDB文件中原有Keap1蛋白Kelch区与包含ETGE序列的Nrf2片段相互作用，综合评价，初步筛选出食源性抗氧化寡肽。