[发明专利]用于多重核酸测序的Index和引物有效
申请号: | 201610645107.0 | 申请日: | 2016-08-08 |
公开(公告)号: | CN106191045B | 公开(公告)日: | 2019-10-11 |
发明(设计)人: | 王绪敏;刘贵明;赵倍伦;王国良;于军 | 申请(专利权)人: | 中国科学院北京基因组研究所 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C40B50/06;C12Q1/6869;C12Q1/04 |
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地址: | 101000 北京市朝阳区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明涉及分子生物学技术领域,具体涉及用于多重核酸测序的Index和构建16SrRNA多重核酸测序文库的PCR引物。本发明提供的Index充分考虑到索引标签之间的序列差异程度、碱基识别率以及测序反应对不同Index序列的数据产出偏好性,将其包含于测序或建库引物后,混合测序反应得到的测序数据平衡性相对较好。本发明提供的PCR引物非常适用于土壤样品,特异性强,目的扩增条带清晰、无弥散现象,使得土壤样品中细菌多样性研究更加高效便捷准确。本发明提供的PCR引物中含有本发明提供的Index,获得的扩增产物中含有两个Index标签,将该Index用于混合样品测序,能够实现对不同测序文库的区分。 | ||
搜索关键词: | 用于 多重 核酸 index 引物 | ||
【主权项】:
1.一组用于构建土壤样品中细菌16SrRNA多重测序文库的PCR引物,其特征在于:所述的一组PCR引物包括正向引物组和反向引物组;所述的正向引物组由以下引物中的一条或多条组成:引物Fl:其核苷酸序列为SEQ ID NO:1所示的序列,其中含有Index1:TGTACGCT;引物F2:其核苷酸序列为SEQ ID NO:2所示的序列,其中含有Index2:GACTAGTC;引物F4:其核苷酸序列为SEQ ID NO:4所示的序列,其中含有Index4:ACTAGATG;引物F5:其核苷酸序列为SEQ ID NO:5所示的序列,其中含有Index5:GATGTACA;引物F6:其核苷酸序列为SEQ ID NO:6所示的序列,其中含有Index6:GATCATGC;引物F7:其核苷酸序列为SEQ ID NO:7所示的序列,其中含有Index7:CATGTCTA;引物F8:其核苷酸序列为SEQ ID NO:8所示的序列,其中含有Index8:TATGTCAC;引物F9:其核苷酸序列为SEQ ID NO:9所示的序列,其中含有Index9:TCTAGCAT;引物F10:其核苷酸序列为SEQ ID NO:10所示的序列,其中含有Index10:GATCACTA;引物F12:其核苷酸序列为SEQ ID NO:12所示的序列,其中含有Index12:TCTACAGA;引物F13:其核苷酸序列为SEQ ID NO:13所示的序列,其中含有Index13:TACAGCGT;所述的反向引物组由以下引物中的一条或多条组成:引物R14:其核苷酸序列为SEQ ID NO:48所示的序列,其中含有Index14:GTGACTAT;引物R15:其核苷酸序列为SEQ ID NO:49所示的序列,其中含有Index15:TGCTACAT;引物R16:其核苷酸序列为SEQ ID NO:50所示的序列,其中含有Index16:TGATCTAC;引物R18:其核苷酸序列为SEQ ID NO:52所示的序列,其中含有Index18:TCGTGATA;引物R19:其核苷酸序列为SEQ ID NO:53所示的序列,其中含有Index19:ACTGCATA;引物R20:其核苷酸序列为SEQ ID NO:54所示的序列,其中含有Index20:ATAGTGCT;引物R22:其核苷酸序列为SEQ ID NO:56所示的序列,其中含有Index22:ACTCATGA;引物R23:其核苷酸序列为SEQ ID NO:57所示的序列,其中含有Index23:GTACATGA;引物R25:其核苷酸序列为SEQ ID NO:59所示的序列,其中含有Index25:CACGTGAT;引物R26:其核苷酸序列为SEQ ID NO:60所示的序列,其中含有Index26:CATCGAGT。
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