[发明专利]一组用于鉴别猪种的SNP标记及其应用在审

专利信息
申请号: 201610075499.1 申请日: 2016-02-03
公开(公告)号: CN105603089A 公开(公告)日: 2016-05-25
发明(设计)人: 龙毅;温庆琪;肖俊峰;吴德;丁能水 申请(专利权)人: 漳州傲农现代农业开发有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 厦门市新华专利商标代理有限公司 35203 代理人: 李宁
地址: 363200 福建省漳*** 国省代码: 福建;35
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摘要: 发明公开了一组用于鉴别猪种的SNP标记,主要利用纯种的大白、长白共200个个体作为研究对象,对上述2个品种的全部样本进行全基因组SNP 60K芯片扫描判型;对所有数据按要求进行质控后,筛选出可以用于鉴别长白、大白的SNP标记位点,通过全基因组关联分析筛选出16个SNP位点用于长白和大白猪的鉴别;另外通过主成分分析和聚类分析在另外500个个体中进行验证,16个SNP位点的准确率达到了99%,表明本发明的16个SNP位点可以用于大白和长白的鉴别。
搜索关键词: 一组 用于 鉴别 snp 标记 及其 应用
【主权项】:
一组用于鉴别猪种的SNP标记,其特征在于:包含16个SNP标记,分别为猪全基因组ALGA0010391位置的G或A、ASGA0106427位置的A或G、MARC0074457位置的G或A、ALGA0035291位置的G或A、ASGA0092666位置的G或A、MARC0097281位置的G或A、ALGA0036113位置的G或A、ALGA0046197位置的G或A、ASGA0094206位置的G或A、ASGA0051087位置的C或A、ALGA0063798位置的G或A、CASI0006417位置的G或A、MARC0070175位置的C或A、H3GA0043987位置的C或A、DBMA0000205位置的G或A及ALGA0093437位置的G或A。
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