[发明专利]一种牦牛FOXO3基因单核苷酸多态性的检测方法及试剂盒有效
申请号: | 201610004491.6 | 申请日: | 2016-01-05 |
公开(公告)号: | CN105441569B | 公开(公告)日: | 2018-10-19 |
发明(设计)人: | 张全伟;赵兴绪;王琪;张勇;马友记 | 申请(专利权)人: | 甘肃农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 汤东凤 |
地址: | 730070 *** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | 本发明涉及基因多态性检测技术领域,具体涉及一种牦牛FOXO3基因单核苷酸多态性的检测方法及其试剂盒,包括以下步骤:步骤一:制备牦牛FOXO3基因扩增产物;步骤二:合成高低温内标;步骤三:制备HRM‑PCR扩增产物;步骤四:收集荧光信号。本发明所设计的基因探针比现有技术中的HRM‑PCR法检测多态性位点定位更加准确、灵敏、且分型准确,不需要PCR后处理,工作效率高、重复性好对样本的质和量要求不高,同时本发明检测试剂盒敏感度高,检测快速,稳定性好,能够实现高通量检测,也能够实现低通量的检测,灵活性高,对牦牛的遗传标记育种奠定基础。 | ||
搜索关键词: | 一种 foxo3 基因 核苷酸 多态性 检测 方法 试剂盒 | ||
【主权项】:
1.一种牦牛FOXO3基因单核苷酸多态性的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤一:制备牦牛FOXO3基因扩增产物:首先提取牦牛血液基因组DNA,将其稀释后,以基因组DNA为模版,以牦牛FOXO3基因序列设计特异性引物对1、特异性引物对2、特异性引物对3和特异性引物对4,PCR扩增牦牛FOXO3基因,得到PCR扩增产物后纯化,取纯化后PCR扩增产物测序,根据测序结果鉴定牦牛FOXO3基因,并找出单核苷酸多态性位点;步骤二:合成高低温内标:通过高分辨率熔解曲线分析牦牛FOXO3基因单核苷酸多态位点的DNA探针,进行基因型分析,合成高低温内标,并对熔解曲线进行校正,所述牦牛FOXO3基因单核苷酸多态位点的DNA探针包括针对FOXO3基因98077A/G位点的探针、针对FOXO3基因98109A/G位点的探针、针对FOXO3基因98226G/C位点的探针;步骤三:制备HRM‑PCR扩增产物:取FOXO3基因的基因组DNA,加入步骤二所述的牦牛FOXO3基因单核苷酸多态位点的DNA探针,进行HRM‑PCR扩增,得到HRM‑PCR扩增产物;步骤四:收集荧光信号:将步骤二合成的高低温内标稀释,并与步骤三制备的HRM‑PCR扩增产物混合,于高分辨率熔解曲线分析系统中收集荧光信号,通过不同的荧光检测结果确定检测SNP位点处碱基突变的基因型。
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