[发明专利]用于评估治疗对生物过程和途径的效果的方法

摘要

本发明提供了用于鉴定具有期望生物活性的药剂的作用机制的方法、系统和装置。具体地，所述方法、系统和装置鉴定感兴趣的成分或化合物借以实现有益治疗效果的目标生物过程和途径。对于目标生物过程和途径集中的每一个而言，代表当用感兴趣的成分或化合物治疗时所述生物过程或途径中的基因表达差异的治疗向量与代表在存在或不存在临床状况时基因表达差异的临床向量作比较。所述两个向量之间的向量距离与其它化合物和/或生物过程和途径的向量距离相比较，以确定感兴趣的成分或化合物对所述特定生物过程或途径的效果。

主权项

一种用于评估治疗效果的系统，所述系统包括：计算机处理器；一个或多个存储器装置，所述一个或多个存储器装置联接到所述计算机处理器并存储：与目标过程或途径相关的基因列表；展示所述治疗对基因集的效果的治疗基因组数据集，所述基因集至少包括与所述目标过程或途径相关的所述基因；展示目标特征对基因集的效果的临床基因组数据集，所述基因集至少包括与所述目标过程或途径相关的所述基因；代表各种材料和/或状况对基因集的效果的参考基因组数据集，所述基因集至少包括与所述目标过程或途径相关的所述基因；和机器可读指令集，所述机器可读指令集能够操作以导致所述处理器执行以下操作：利用所述治疗数据计算治疗向量；利用所述临床数据计算临床向量；计算所述治疗向量与所述临床向量之间的向量距离；计算参考向量集；计算所述临床向量与所述参考向量集中的每一个之间的向量距离集；确定所述向量距离集的分布；以及计算所述向量距离在所述向量距离集内的百分位数。