[发明专利]基于易感SNP筛查复杂疾病易感SNP组合的方法

摘要

本发明公开一种基于易感SNP筛查复杂疾病易感SNP组合的方法。本发明的方法可以迅速从大量数据中找到特定疾病的易感SNP组合。本发明采用易感SNP组合的方法旨在提供一种新的疾病风险评价的方法。易感SNP组合对于疾病风险的评估可能更优于单一易感SNP位点的风险评估效果，类似于低频突变导致遗传疾病效果。从具体实例结果看易感SNP组合的方法在复杂疾病风险预测中的效果可能会达到1，这是单个易感SNP不可能达到的效果。该方法可以应用于任何复杂疾病易感SNP组合的筛查和疾病遗传风险的预测。 1

主权项

1.一种基于易感SNP筛查复杂疾病易感SNP组合的方法，其特征在于包括如下步骤：从已知的文献中找出与特定疾病相关的易感SNP，下载个体全基因组的SNP分型数据，把每个个体易感SNP位点的基因型数据分离出来，然后将这些易感SNP位点按一个顺序排列，如果某个易感SNP位点含有一个以上易感等位基因，用特定的英文字母来标记，这样每一个个体就会得到一个等于或少于易感SNP位点数的字母字符串；然后分别统计患病组和对照组中各种字符串的个数，并在患病组中找出对照组所没有的字符串，再从中选出个数明显较多的字符串，再反过来按顺序将字母转换为基因型，最终得到易感SNP组合。