[发明专利]确定生物样本中游离核酸比例的方法、装置及其用途

摘要

本发明公开了确定生物样本中预定来源的游离核酸比例的方法、装置及其用途，其中，该方法包括：(1)对含有游离核酸的生物样本进行核酸测序，以便获得多个测序数据的测序结果；(2)基于所述测序结果，确定所述样本中长度落入预定范围的核酸分子的数目；以及(3)基于所述长度落入预定范围的核酸分子的数目，确定所述生物样本中所述游离核酸的比例。利用该方法能够准确高效地确定生物样本中预定来源的游离核酸的比例，尤其适用于确定孕妇外周血中的胎儿核酸，以及肿瘤患者外周血中肿瘤核酸的比例。

主权项

1.一种确定生物样本中预定来源的游离核酸比例的方法，其特征在于，包括：(1)对含有游离核酸的生物样本进行核酸测序，以便获得由多个测序数据构成的测序结果；(2)基于所述测序结果，确定所述样本中长度落入预定范围的核酸分子的数目；以及(3)基于所述长度落入预定范围的核酸分子的数目，确定所述生物样本中所述预定来源的游离核酸比例，步骤(3)进一步包括：(3‑1)基于所述长度落入预定范围的核酸分子的数目，确定在所述预定范围内出现游离核酸分子的频率；以及(3‑2)基于在所述预定范围内出现游离核酸分子的频率，根据预定的函数，确定所述生物样本中预定来源的游离核酸的比例，其中，所述预定的函数是基于所述多个对照样品确定的，所述预定来源的游离核酸为孕妇外周血中的游离胎儿DNA；所述预定的函数是通过下列步骤获得的：(i)分别在所述多个对照样品中，确定在所述预定范围内出现游离核酸分子的频率；以及(ii)将所述多个对照样品中在所述预定范围内出现游离核酸分子的频率与已知的预定来源的游离核酸比例进行拟合，以便确定所述预定的函数；所述预定范围是基于多个对照样品确定的，其中，所述对照样品中预定来源的游离核酸比例是已知的；所述预定范围是通过下列步骤确定的：(a)确定所述多个对照样品中所包含游离核酸分子的长度；(b)设定多个候选长度范围，并分别确定所述多个对照样品在各候选长度范围内出现游离核酸分子的频率；(c)基于所述多个对照样品在各候选长度范围内出现游离核酸分子的频率以及所述对照样品中预定来源的游离核酸比例，确定各所述候选长度范围与所述预定来源的游离核酸比例的相关性系数；以及(d)基于所述相关性系数的数值，确定至少一个候选长度范围或者候选长度范围组合作为所述预定范围。