[发明专利]一种基于高分辨率熔解曲线的多SNP鉴定方法有效
申请号: | 201410349635.2 | 申请日: | 2014-07-22 |
公开(公告)号: | CN104131092A | 公开(公告)日: | 2014-11-05 |
发明(设计)人: | 郭涛;罗文龙;王加峰;黄翠红;周丹华;陈志强;王慧 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 林丽明 |
地址: | 510642 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明属于农业生物技术领域,具体公开一种基于高分辨率熔解曲线的多SNP鉴定方法。本发明针对目前SNP鉴定的局限性,将多重PCR、巢式PCR、等位特异性PCR相结合,提出基于高分辨率熔解曲线的多SNP鉴定方法。本方法利用多重PCR实现2~4个基因片段扩增,提高实验效率,降低实验成本;利用巢式PCR提高扩增片段特异性,获得高质量、浓度均一的DNA模板,提高HRM技术稳定性;利用等位特异性PCR,实现SNP位点判别,避免荧光标记的设定或繁琐的电泳及酶切操作;通过上述方法的综合运用,实现多个SNP的批量鉴定、降低实验成本。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 高分辨率 熔解 曲线 snp 鉴定 方法 | ||
【主权项】:
一种基于高分辨率熔解曲线的多SNP鉴定方法,其特征在于,包括如下步骤:S1.样品DNA提取;S2.针对待测基因,设计一对扩增SNP位点的外引物;S3.以样品DNA为模板,加入外引物,构建PCR反应体系,进行第一轮扩增;S4.第一轮扩增产物进行稀释,分装至编号为A、B的PCR管;S5.针对SNP位点,设计由3’段碱基错配的引物搭配构成的内引物对1和内引物对2;S6.在A管中加入内引物对1,在B管中加入内引物对2,构建PCR反应体系,进行第二轮扩增;S7.第二轮扩增产物进行高分辨率熔解曲线分析,判定SNP类型。
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