[发明专利]一种基于遗传背景的鱼类亲本选择系统及方法有效
申请号: | 201410198287.3 | 申请日: | 2014-05-12 |
公开(公告)号: | CN103942466B | 公开(公告)日: | 2017-03-29 |
发明(设计)人: | 匡友谊;佟广香;郑先虎;孙效文 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所 |
主分类号: | G06F19/10 | 分类号: | G06F19/10 |
代理公司: | 哈尔滨市松花江专利商标事务所23109 | 代理人: | 张宏威 |
地址: | 150070 黑龙*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
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摘要: | 一种基于遗传背景的鱼类亲本选择系统及方法,属于利用分子生物学DNA分子标记进行鱼类繁殖时亲本选择的数据分析技术领域。本发明解决了现有基于遗传背景的分析过程复杂、需要多个处理工具配合实现的问题。所述亲本选择系统包括数据转换装置、格式转换装置、构建聚类树装置、遗传距离计算装置、近交系数计算装置、亲缘系数计算装置、群体繁殖亲本选择装置、家系繁殖亲本选择装置、家系繁殖组合装置和群体繁殖组合装置。所述亲本选择方法包括数据转换、格式转换、构建聚类树、遗传距离计算、近交系数计算、亲缘系数计算、群体繁殖亲本选择、家系繁殖亲本选择、家系繁殖组合和群体繁殖组合的步骤。本发明适用于对鱼类繁殖时亲本选择技术领域。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 遗传 背景 鱼类 亲本 选择 系统 方法 | ||
【主权项】:
一种基于遗传背景的鱼类亲本选择系统,其特征在于,所述系统由以下部分组成:格式转换装置,用于常用群体遗传学分析软件输入数据格式转换;构建聚类树装置,用于利用分子标记数据采用phylip软件构建个体间聚类树;遗传距离计算装置,用于利用分子标记数据采用phylip软件进行个体间的遗传距离计算;近交系数计算装置,用于利用分子标记数据进行个体的近交系数计算;亲缘系数计算装置,用于利用分子标记数据进行个体间的亲缘系数计算;群体繁殖亲本选择装置,用于利用分子标记数据进行基于亲缘系数的群体繁殖亲本选择;家系繁殖亲本选择装置,用于利用分子标记数据、个体的性别数据进行基于亲缘系数的家系繁殖亲本选择;家系繁殖组合装置,用于利用分子标记数据、个体的性别数据、个体聚类树数据进行遗传距离聚类树结合亲缘系数评估的家系繁殖亲本组合;群体繁殖组合装置,用于利用分子标记数据、个体的性别数据、个体聚类树数据进行遗传距离聚类树结合亲缘系数进行的群体繁殖组合。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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