[发明专利]聚合酶链式反应产物测序分型的方法及系统有效
申请号: | 201310634809.5 | 申请日: | 2013-12-02 |
公开(公告)号: | CN103617375B | 公开(公告)日: | 2017-08-25 |
发明(设计)人: | 陈永胜;蒋帅;龚小龙 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因健康科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/22 | 分类号: | G06F19/22 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙)11201 | 代理人: | 张大威 |
地址: | 518083 广东省深圳市盐*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明提出了一种聚合酶链式反应产物测序分型的方法,包括以下步骤提供待分型碱基序列、文件信息和引物文件信息;根据文件信息和参考序列的等位基因型别信息识别待分型碱基序列和参考序列的联配位置关系,得到第一待分析候选型别组合;根据引物文件信息和参考序列的引物信息对待分型碱基序列进行分型识别,得到第二待分析候选型别组合;根据第一和第二待分析候选型别组合得到待分型碱基序列的最终型别。根据本发明的实施例具有分型效率高、分型准确可靠且分型时间短以及人力成本低的优点。本发明还提出了一种聚合酶链式反应产物测序分型的系统。 | ||
搜索关键词: | 聚合 链式反应 产物 测序分型 方法 系统 | ||
【主权项】:
一种聚合酶链式反应产物测序分型的方法,其特征在于,包括以下步骤:获取待分型碱基序列、与所述待分型碱基序列关联的文件信息和引物文件信息,其中,所述文件信息包括所述待分型碱基序列的位点名称;根据所述文件信息和参考序列的等位基因型别信息识别所述待分型碱基序列和参考序列的联配位置关系,以得到第一待分析候选型别组合;根据所述引物文件信息和所述参考序列的引物信息对所述待分型碱基序列进行进一步分型识别,以得到第二待分析候选型别组合;以及根据所述第一待分析候选型别组合和所述第二待分析候选型别组合得到所述待分型碱基序列的最终型别。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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