[发明专利]用于使用聚类来检测生物学状态的存在的系统和方法

摘要

一种用于判定生物学实体的存在的方法。该方法可以包含至少将与多个样品关联的与第一遗传因子（例如，mecA）关联的多个第一输入值、与第二遗传因子（femA）关联的多个第二输入值、以及与第三遗传因子（例如，orfX）关联的多个第三输入值输入到数字计算机中。每个已知样品包括多个第一输入值中的一个第一输入值、多个第二输入值中的一个第二输入值、以及多个第三输入值中的一个第三输入值。该方法还包括确定与第三遗传因子关联的阈值，使用该阈值将样品分离成为第一组样品和第二组样品，在由第一遗传因子和第二遗传因子限定的特征空间中聚类第一组样品，使用第一组样品来限定第一边界空间，以及使用第二组样品来限定第二边界空间。第一和第二边界空间将生物学状态与其它生物学状态区分开来。其它实施例还可以包含使用诸如SCCmec的遗传因子。

主权项

一种方法，其特征在于，包括：至少将与多个已知样品关联的与第一遗传因子关联的多个第一输入值、与第二遗传因子关联的多个第二输入值、以及与第三遗传因子关联的多个第三输入值输入到数字计算机中，其中，每个已知样品包括所述多个第一输入值中的一个第一输入值、所述多个第二输入值中的一个第二输入值、以及所述多个第三输入值中的一个第三输入值；确定与所述第三遗传因子关联的阈值；使用所述阈值将所述已知样品分离成为第一组已知样品和第二组已知样品；在由所述第一遗传因子和所述第二遗传因子限定的特征空间中聚类所述第一组已知样品；使用所述第一组已知样品限定第一边界空间，其中，所述第一边界空间将生物学状态与其它生物学状态区分开来；以及使用所述第二组已知样品限定第二边界空间，其中，所述第二边界空间将生物学状态与其它生物学状态区分开来。